130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4021 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  517  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  79.75 
 
 		 254 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  75.81 
 
 		 253 aa  391  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  75.81 
 
 		 259 aa  390  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  69.48 
 
 		 260 aa  364  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  74.47 
 
 		 274 aa  358  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  67.07 
 
 		 273 aa  348  4e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  65.08 
 
 		 255 aa  338  5e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  64.31 
 
 		 255 aa  334  5.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2311  spermidine synthase-like protein  53.82 
 
 		 307 aa  251  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3059  spermidine synthase-like protein  54.44 
 
 		 365 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110993  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  44.22 
 
 		 291 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  44.27 
 
 		 295 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  43.82 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  45 
 
 		 387 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  45 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  45 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  45 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  45.27 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  45 
 
 		 309 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  45 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  45 
 
 		 398 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  45 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  44.26 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  45 
 
 		 364 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  45 
 
 		 305 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  44.58 
 
 		 305 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  44.58 
 
 		 305 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  44.58 
 
 		 305 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  44.77 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  44.17 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  44.17 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  44.17 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  43.98 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  43.24 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  38.46 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  40.16 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  40.08 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  40.69 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  33.62 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  33.73 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  33.75 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  32.75 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  36.45 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  31.15 
 
 		 275 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  39.43 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  33.78 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  33.49 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  33.49 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  30.83 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  33.66 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  33.49 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  33.87 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  33.87 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  29.57 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  29.57 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  31.88 
 
 		 274 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  33.51 
 
 		 259 aa  92.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  31.05 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  31.72 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  30.53 
 
 		 278 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  28.1 
 
 		 278 aa  88.6  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  31.1 
 
 		 231 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  30.41 
 
 		 282 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  28.11 
 
 		 271 aa  86.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  29.44 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  29.44 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  31.05 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  28.75 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2160  spermine synthase  28.33 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55651  normal  0.223021 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  27.43 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  25.59 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  28.3 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  29.55 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  23.88 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  28.02 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  24.51 
 
 		 270 aa  62  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  28.29 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  27.75 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  27.75 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  27.75 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  26.14 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  21.24 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  26.56 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  28.48 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  30.1 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0927  spermine synthase  26.44 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  27.76 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  29.44 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  25.83 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  25.82 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  27.76 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  29.47 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  26.73 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  26.73 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  26.73 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  24.68 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 304 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  26.82 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  24.87 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>