198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0615 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  100 
 
 		 248 aa  508  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  58.7 
 
 		 247 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  58.7 
 
 		 247 aa  318  5e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  58.7 
 
 		 247 aa  318  5e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  56.91 
 
 		 247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  55.87 
 
 		 261 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  55.87 
 
 		 261 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  55.87 
 
 		 247 aa  301  9e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  55.47 
 
 		 247 aa  298  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  55.47 
 
 		 247 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  56.1 
 
 		 247 aa  291  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  53.66 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0745  spermine synthase  54.07 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0927  spermine synthase  51.42 
 
 		 247 aa  260  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0828  spermine synthase  51.63 
 
 		 247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.547147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0791  spermine synthase  52.03 
 
 		 247 aa  251  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618517 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2160  spermine synthase  40.34 
 
 		 242 aa  175  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55651  normal  0.223021 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  34.98 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2384  spermidine synthase-like protein  34.89 
 
 		 262 aa  118  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  33.47 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  33.19 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  35.06 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  35.09 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  35.26 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  34.48 
 
 		 262 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  32.49 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  35.67 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  34.09 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  34.5 
 
 		 251 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  34.5 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  33.92 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  32.77 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  31.91 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  30.41 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  28.11 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  31.68 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  33.17 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1760  hypothetical protein  33.52 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  28.99 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  32.2 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  32.5 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  27.95 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  31.87 
 
 		 291 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  30.13 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  28.04 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  29.82 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  25.26 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  28.04 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  26.53 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  28.99 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  27.27 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  29.55 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  29.3 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  30.85 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  30.85 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  29.31 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  29.52 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  31.76 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  27.46 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  27.23 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  29.05 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  29.05 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  30.51 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  30.54 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  28.02 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  24.1 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  27.27 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  24.1 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  24.1 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  27.73 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  28.78 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  32.34 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  28.72 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  29.01 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1674  hypothetical protein  29.49 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  27.89 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  28.72 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  28.72 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  29.76 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1668  hypothetical protein  26.92 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  29.76 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  24.66 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  29.76 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  29.76 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  29.76 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  29.76 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  29.76 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  31.74 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  31.74 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  31.74 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  27.21 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  26.53 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  26.53 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  26.53 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  26.53 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  29.17 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  26.53 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  27.82 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>