221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1476 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  527  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  91.98 
 
 		 261 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  92.83 
 
 		 251 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  92.03 
 
 		 251 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  84.06 
 
 		 251 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  82.66 
 
 		 253 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  81.85 
 
 		 253 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  79.84 
 
 		 249 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  77.24 
 
 		 259 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  66.12 
 
 		 249 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  66.12 
 
 		 249 aa  334  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  35.51 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  34.41 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  34.29 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  33.6 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  34.01 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  34.01 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  34.01 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  34.29 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  34.29 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  28.39 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  27.78 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  34.3 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  34.48 
 
 		 248 aa  93.2  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2160  spermine synthase  29.91 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55651  normal  0.223021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0745  spermine synthase  30.96 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  32.73 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2384  spermidine synthase-like protein  31.97 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  32.56 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0502  hypothetical protein  32.75 
 
 		 258 aa  82  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  33.5 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  31.55 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  30.48 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0828  spermine synthase  29.96 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.547147 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  25.21 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  28.4 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  30.47 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  32.28 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  30.48 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  30.48 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  30.48 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  29.59 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  30.48 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  28.19 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  28.29 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0927  spermine synthase  29.61 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  28.1 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  28.1 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  32.05 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  25.98 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  26.78 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  32.72 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  26.78 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  26.78 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  28.1 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  29.02 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  29.02 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  26.78 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  29.02 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  26.78 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  26.78 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  26.78 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  27.27 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  27.72 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  28.16 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  30.52 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  27.63 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  27.2 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  28.03 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  25.45 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  28.03 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  28.03 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  27.69 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  29.7 
 
 		 305 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  27.9 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  28.08 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  28.57 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  27.51 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  30.9 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  32.26 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  30.64 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  29.26 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  27.08 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0791  spermine synthase  32.48 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618517 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  28.48 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  22.82 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  28.48 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  29.41 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  26.9 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  30.57 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  26.03 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  28.09 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  26.03 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  28.57 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  29.95 
 
 		 308 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  29.95 
 
 		 308 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  27.12 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  30.24 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  33.33 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  28.08 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>