240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5272 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 281 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  43.78 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  46.83 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  44.22 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  42.01 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  44.04 
 
 		 264 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  44.04 
 
 		 264 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  43.83 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  43.83 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  40.25 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  43.83 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  38.91 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  38.91 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  45.83 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  46.79 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  46.32 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  47.03 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  38 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  42.16 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  42.16 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  41.92 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  41.55 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  43.55 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  40.69 
 
 		 282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  40.58 
 
 		 278 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  40.58 
 
 		 278 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  39.44 
 
 		 239 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  40.78 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  39.46 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  39.9 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  35.87 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  35.29 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  35.29 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  34.22 
 
 		 309 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  34.22 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  34.22 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  34.22 
 
 		 309 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  34.22 
 
 		 309 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  33.99 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  34.76 
 
 		 364 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  34.22 
 
 		 387 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  34.22 
 
 		 398 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  33.99 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  33.99 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  33.99 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  32.81 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  33.78 
 
 		 256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  34.62 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  34.22 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  31.53 
 
 		 310 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  31.53 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  34.03 
 
 		 291 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  35.6 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  28 
 
 		 253 aa  99.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  30 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  32.11 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  97.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2311  spermidine synthase-like protein  32.83 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  31.2 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  30.43 
 
 		 274 aa  96.3  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  29.82 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  27.32 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  31.28 
 
 		 273 aa  93.2  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  31.31 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  31.72 
 
 		 255 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  29.23 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  30 
 
 		 248 aa  88.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  32.26 
 
 		 259 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  30.15 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  30.21 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  32.26 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  32.51 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  30.25 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  31.95 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  35.25 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  33.12 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  30.5 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  29.21 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  32.9 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  34.87 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  33.11 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  31.82 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3059  spermidine synthase-like protein  28.87 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110993  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  29.94 
 
 		 558 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  31.17 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  31.17 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  30.52 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  28.86 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  31.17 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  29.87 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  29.87 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  27.86 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  27.86 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  27.86 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  31.94 
 
 		 516 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  28.24 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  34.75 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  29.84 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0502  hypothetical protein  30.21 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>