124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1009 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  99.03 
 
 		 387 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  99.35 
 
 		 309 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  99.03 
 
 		 398 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  92.23 
 
 		 364 aa  583  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  81.88 
 
 		 305 aa  511  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  81.55 
 
 		 305 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  81.23 
 
 		 305 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  81.23 
 
 		 305 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  81.23 
 
 		 305 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  80.58 
 
 		 305 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  80.58 
 
 		 305 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  73.87 
 
 		 305 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  71.29 
 
 		 310 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  71.15 
 
 		 310 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  58.33 
 
 		 291 aa  334  9e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  57.69 
 
 		 291 aa  331  8e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  59.33 
 
 		 310 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  58.36 
 
 		 295 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  58.67 
 
 		 315 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  52.46 
 
 		 259 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  54.24 
 
 		 251 aa  258  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  51.01 
 
 		 306 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3059  spermidine synthase-like protein  46.56 
 
 		 365 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110993  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  46.44 
 
 		 273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  44.94 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  45 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  43.51 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2311  spermidine synthase-like protein  48.78 
 
 		 307 aa  189  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  43.93 
 
 		 255 aa  188  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  43.1 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  40.24 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  42.26 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  42.26 
 
 		 259 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  41.1 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  40.69 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  33.33 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  36.56 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  39.09 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  34.04 
 
 		 261 aa  139  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  37.12 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  37.12 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  35.78 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  34.29 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  34.22 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  33 
 
 		 259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  34.01 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  30.9 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  30.1 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  32.47 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  30.38 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  31.78 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  26.91 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  26.91 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  31.58 
 
 		 278 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  31.58 
 
 		 278 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  33.02 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  33.02 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  33.02 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  32.37 
 
 		 239 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  32.63 
 
 		 274 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  29.96 
 
 		 278 aa  95.5  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  29.9 
 
 		 235 aa  94.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  29.9 
 
 		 235 aa  94.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  26.48 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  31.73 
 
 		 231 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  25.69 
 
 		 252 aa  89  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  34.12 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  33.5 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  22.9 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  26.78 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  27.51 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  26.39 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  28.95 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  27.62 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  25.83 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  30 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  26.16 
 
 		 249 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  26.81 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  27.31 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  26.25 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  26.81 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  26.78 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  26.38 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  26.38 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  24.2 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  29.76 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  27.08 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2160  spermine synthase  27 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55651  normal  0.223021 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  28.05 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  27.32 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  25 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  25.12 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  28.28 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  29.3 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  26.87 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  27.23 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>