123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3059 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3059  spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 365 aa  727    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110993  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  54.96 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  54.79 
 
 		 255 aa  279  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2311  spermidine synthase-like protein  57.41 
 
 		 307 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  54.62 
 
 		 255 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  54.23 
 
 		 254 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  54.44 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  53.1 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  53.1 
 
 		 259 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  52.02 
 
 		 274 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  47.35 
 
 		 273 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  50 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  50 
 
 		 291 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  49.8 
 
 		 295 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  49.81 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  49.03 
 
 		 310 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  48.45 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  46.56 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  46.26 
 
 		 364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  46.56 
 
 		 309 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  46.56 
 
 		 309 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  46.56 
 
 		 309 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  47.49 
 
 		 310 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  46.56 
 
 		 387 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  46.56 
 
 		 309 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  46.56 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  47.29 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  47.08 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  47.47 
 
 		 305 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  47.47 
 
 		 305 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  47.47 
 
 		 305 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  45.91 
 
 		 305 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  46.3 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  46.3 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  43.53 
 
 		 306 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  39.27 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  36.76 
 
 		 259 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  39.75 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  36.47 
 
 		 261 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  38.06 
 
 		 258 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  31.64 
 
 		 267 aa  126  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  32.88 
 
 		 255 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  30.47 
 
 		 289 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  32.08 
 
 		 275 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  28.51 
 
 		 264 aa  99.4  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  28.51 
 
 		 264 aa  99.4  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  31.14 
 
 		 255 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  29.88 
 
 		 257 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  29.34 
 
 		 277 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  30.58 
 
 		 261 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  32.71 
 
 		 269 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  32.24 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  30.45 
 
 		 253 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  32.24 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  32.27 
 
 		 278 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  32.27 
 
 		 278 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  29 
 
 		 271 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  29.92 
 
 		 282 aa  89.4  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  31.28 
 
 		 278 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  31.28 
 
 		 278 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  32.47 
 
 		 239 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  28.78 
 
 		 259 aa  86.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  30.41 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  31.31 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  29.55 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  30.73 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  27.83 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  27.05 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  27.05 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  24.69 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  24.69 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  28.02 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  29.72 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  27.9 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  22.78 
 
 		 247 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  22.78 
 
 		 247 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  25.93 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  29.72 
 
 		 261 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  21.79 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  26.67 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  26.67 
 
 		 261 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  26.67 
 
 		 261 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  22.67 
 
 		 247 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  26.67 
 
 		 247 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  22.82 
 
 		 311 aa  53.9  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  29.25 
 
 		 251 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  26.83 
 
 		 247 aa  53.5  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  25.26 
 
 		 247 aa  53.9  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  28.7 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  24.38 
 
 		 247 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1964  spermidine synthase  28.12 
 
 		 291 aa  50.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.569543  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  23.42 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2160  spermine synthase  25.22 
 
 		 242 aa  49.7  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55651  normal  0.223021 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  22.94 
 
 		 270 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  28.83 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  26.94 
 
 		 248 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  27.96 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0502  hypothetical protein  22.93 
 
 		 258 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0791  spermine synthase  35.63 
 
 		 247 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  26.19 
 
 		 259 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>