99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0502 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0502  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  527  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  35.23 
 
 		 249 aa  89  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  31.98 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  34.33 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  34.09 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  32.79 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  33.14 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  32.75 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  32.75 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  32.75 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  29.19 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  32.75 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  31.98 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  31.98 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  28.44 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  32.2 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  29.05 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  32.2 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  29.05 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  32.2 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  28.96 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  28.95 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  28.95 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  32.22 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  29.76 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  29.76 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  30.49 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  24.88 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  30.25 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  31.87 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  26.67 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  30.25 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  30.21 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  29.63 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  29.63 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  25.57 
 
 		 308 aa  62  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  28.99 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  29.63 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  29.07 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  28.99 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  34.13 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  28.99 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  28.99 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  30.06 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  30.91 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  28.31 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  28.42 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  26.15 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  28.49 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  28.4 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  28.4 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  28.4 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  28.51 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  28.05 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  26.04 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  24.87 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  29.35 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  26.96 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  23.68 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  28.57 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  22.22 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  29.12 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  21.89 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  28.4 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1760  hypothetical protein  26.86 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  28.24 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  28.57 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  25.98 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2311  spermidine synthase-like protein  25.98 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  26.97 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  26.96 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  29.14 
 
 		 607 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  23.11 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0927  spermine synthase  29.34 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0745  spermine synthase  27.96 
 
 		 247 aa  45.4  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  23.16 
 
 		 310 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  23.24 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  33.87 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  24.07 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  24.51 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  24.07 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  24.07 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  21.76 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  24.81 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  24.68 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  31.58 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  24.39 
 
 		 387 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  24.39 
 
 		 398 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  27.82 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  24.39 
 
 		 309 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  26.02 
 
 		 364 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  24.39 
 
 		 309 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  24.39 
 
 		 309 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  24.39 
 
 		 309 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  24.39 
 
 		 387 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  23.42 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  23.42 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  23.72 
 
 		 259 aa  42  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  23.72 
 
 		 253 aa  42  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>