258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0334 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  100 
 
 		 257 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  59.11 
 
 		 284 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  59.11 
 
 		 276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  59.11 
 
 		 269 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  58.51 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  52.57 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  58.08 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  54.39 
 
 		 278 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  54.39 
 
 		 278 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  52.48 
 
 		 278 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  50.2 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  49.39 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  49.39 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  52.97 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  45.53 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  45.53 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  49 
 
 		 235 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  49 
 
 		 235 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  46.83 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  47.14 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  47.57 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  46.5 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  47.74 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  37.7 
 
 		 289 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  40.57 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  40.43 
 
 		 275 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  39.13 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  41.86 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  36.09 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  36.97 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  36.03 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  37.33 
 
 		 364 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  35.78 
 
 		 387 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  35.78 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  35.78 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  35.78 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  35.78 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  35.78 
 
 		 387 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  35.78 
 
 		 398 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  36.7 
 
 		 305 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  35.98 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  36 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  35.51 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  35.02 
 
 		 310 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  34.72 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  34.72 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  36.11 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  36.11 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  35.19 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  36.28 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  33.78 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  35.19 
 
 		 305 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  35.19 
 
 		 305 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  35.19 
 
 		 305 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  33.95 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  34.58 
 
 		 295 aa  105  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  35.38 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  34.25 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  32.57 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  33.93 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  35.15 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  31.05 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  31.36 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  31.11 
 
 		 274 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2311  spermidine synthase-like protein  35.07 
 
 		 307 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  32 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  32 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  30.43 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  28.57 
 
 		 308 aa  88.6  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  31.47 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  27.91 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  29.26 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  29.28 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3059  spermidine synthase-like protein  28.69 
 
 		 365 aa  82  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110993  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  27.18 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  28.04 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  28.14 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  29.09 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  30.77 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  28.03 
 
 		 558 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  33.97 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  31.65 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  29.3 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  32.66 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  38.06 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  32.26 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  31.88 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  32.9 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2160  spermine synthase  29.26 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55651  normal  0.223021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  26.96 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  26.96 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  30.32 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  27.6 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  26.52 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  31.61 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  28.37 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  28.37 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  26.52 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>