225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0169 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 284 aa  574  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  74.91 
 
 		 283 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  30.43 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  29.6 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  33.73 
 
 		 278 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  34.82 
 
 		 282 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  32.9 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  32.8 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  34.13 
 
 		 278 aa  89  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  33.93 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  31.47 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  31.71 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  32.81 
 
 		 239 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  29.96 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  33.33 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  33.33 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  35.61 
 
 		 307 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  29.9 
 
 		 258 aa  85.9  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  33.33 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  29.23 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  32.5 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  33.33 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  33.99 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  29.47 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  29.41 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  29.8 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  29.8 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  35.25 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  30.34 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  28.12 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  27.4 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  31.03 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  29.5 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  30.99 
 
 		 558 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  30.81 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  29.7 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  29.56 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  29.06 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  30.98 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  29.56 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  30.81 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  30.46 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  28.39 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  28.39 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  28.16 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  28.08 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  33.87 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  28.65 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  28.5 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  28.99 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  32.41 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  28.37 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  29.49 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  33.05 
 
 		 903 aa  62.4  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  28.23 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  28.23 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  28.23 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  33.02 
 
 		 533 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  28.5 
 
 		 551 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  28.8 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  28.8 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  27.59 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  28.26 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  29.2 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  27.6 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  30.84 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  25 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  31.43 
 
 		 607 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  27.54 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  24.31 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  28.77 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  26.05 
 
 		 757 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2865  hypothetical protein  28.45 
 
 		 819 aa  55.8  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0368958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4279  hypothetical protein  30.83 
 
 		 818 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  30.4 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  26.72 
 
 		 1040 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  35.94 
 
 		 735 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  27.39 
 
 		 387 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  28.03 
 
 		 364 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  34.55 
 
 		 475 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  27.04 
 
 		 398 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  24.1 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2384  spermidine synthase-like protein  32.14 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  25.61 
 
 		 991 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  27.39 
 
 		 387 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1613  spermine synthase  27.61 
 
 		 753 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0627097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  26.35 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  26.35 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  26.35 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  26.35 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  28.68 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  29.66 
 
 		 517 aa  53.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  28.48 
 
 		 510 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  31.79 
 
 		 248 aa  52.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  29.14 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  31.54 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  27.73 
 
 		 1017 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04883  putative integral membrane protein  29.41 
 
 		 494 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  28.8 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  28.8 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>