91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0533 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 475 aa  924    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  32.4 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  30.02 
 
 		 551 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  28.46 
 
 		 541 aa  96.7  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  31.14 
 
 		 517 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  29.44 
 
 		 502 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  32.87 
 
 		 517 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  21.94 
 
 		 533 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  31.22 
 
 		 500 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  26.75 
 
 		 516 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  26.26 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  23.29 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  27.84 
 
 		 551 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  26.83 
 
 		 524 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  25.74 
 
 		 490 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  29.1 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  28.57 
 
 		 548 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  34.34 
 
 		 296 aa  67  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  29.98 
 
 		 516 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  28.4 
 
 		 514 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  31.1 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  26.72 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  26.72 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  26.46 
 
 		 782 aa  61.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  28.13 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  27.3 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  32.73 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  27.29 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  34.13 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  25.93 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  26.67 
 
 		 529 aa  57.4  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  33.71 
 
 		 203 aa  57  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  33.64 
 
 		 735 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 268 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  34.55 
 
 		 284 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  34.23 
 
 		 277 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  26.56 
 
 		 551 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  30.17 
 
 		 334 aa  53.9  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  31.47 
 
 		 375 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  22.98 
 
 		 510 aa  53.9  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  35.04 
 
 		 349 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  30.53 
 
 		 520 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  35.14 
 
 		 283 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  31.42 
 
 		 284 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  28.57 
 
 		 311 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  36.97 
 
 		 274 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2629  hypothetical protein  34.42 
 
 		 223 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  26.9 
 
 		 759 aa  50.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  37.74 
 
 		 678 aa  50.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  33.33 
 
 		 275 aa  50.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  33.97 
 
 		 269 aa  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  28.5 
 
 		 836 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  31.3 
 
 		 304 aa  50.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  35.9 
 
 		 271 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  33.06 
 
 		 255 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  29.41 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  31.78 
 
 		 520 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  38.58 
 
 		 522 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  31.78 
 
 		 520 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  30.26 
 
 		 272 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  30.49 
 
 		 261 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  33.33 
 
 		 276 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  33.33 
 
 		 284 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  31.03 
 
 		 301 aa  48.9  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  28.21 
 
 		 281 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  30.7 
 
 		 523 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  24.93 
 
 		 1017 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  33.64 
 
 		 278 aa  47.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  35.65 
 
 		 303 aa  47.8  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  30.06 
 
 		 259 aa  47.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  23.74 
 
 		 837 aa  47  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  26.4 
 
 		 220 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  33.04 
 
 		 752 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  20.24 
 
 		 749 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  29.29 
 
 		 290 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  26.23 
 
 		 536 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  32.17 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  35.45 
 
 		 681 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2560  hypothetical protein  30.95 
 
 		 789 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  31.37 
 
 		 262 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  31.9 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  26.45 
 
 		 287 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  23.98 
 
 		 982 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  30.87 
 
 		 983 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  32.05 
 
 		 231 aa  43.9  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  33.69 
 
 		 280 aa  43.5  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  31.18 
 
 		 544 aa  43.5  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  27.39 
 
 		 842 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15982  predicted protein  28.93 
 
 		 332 aa  43.5  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283158  normal  0.0285818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  27.81 
 
 		 322 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>