65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2736 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  100 
 
 		 752 aa  1476    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  37.78 
 
 		 759 aa  436  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  38.21 
 
 		 759 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  37.48 
 
 		 760 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  39.4 
 
 		 759 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  39.03 
 
 		 759 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2560  hypothetical protein  38.65 
 
 		 789 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0123  integral membrane protein-like protein  36.52 
 
 		 752 aa  347  7e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  34.64 
 
 		 678 aa  333  5e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  35.39 
 
 		 674 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  32.09 
 
 		 705 aa  319  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  32.22 
 
 		 705 aa  319  1e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  38.85 
 
 		 735 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  39.62 
 
 		 681 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2698  putative transporter  36.36 
 
 		 744 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0691  hypothetical protein  37.21 
 
 		 791 aa  127  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140408  normal  0.176314 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  30.58 
 
 		 533 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  33.91 
 
 		 500 aa  62  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  31.58 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  35.23 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  31.96 
 
 		 492 aa  55.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  32.87 
 
 		 304 aa  54.3  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  30.87 
 
 		 287 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  30.36 
 
 		 516 aa  53.5  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  30.05 
 
 		 517 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  32.62 
 
 		 268 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  32.06 
 
 		 272 aa  52  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  30.62 
 
 		 502 aa  51.6  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  32.2 
 
 		 514 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  33.94 
 
 		 514 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  31.09 
 
 		 548 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  30.89 
 
 		 551 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  28.12 
 
 		 558 aa  50.4  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 304 aa  50.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  31.96 
 
 		 296 aa  50.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  27.52 
 
 		 516 aa  50.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  26.27 
 
 		 517 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  33.58 
 
 		 538 aa  49.3  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14496  predicted protein  27.66 
 
 		 314 aa  49.3  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161441  normal  0.197799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  30.21 
 
 		 332 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  29.5 
 
 		 257 aa  49.3  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  32.2 
 
 		 514 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  32.2 
 
 		 514 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  30.63 
 
 		 248 aa  47.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  29.82 
 
 		 287 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  29.2 
 
 		 311 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  23.23 
 
 		 334 aa  47.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04663  spermine/spermidine synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08500)  36.97 
 
 		 558 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725678  normal  0.343569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  33.04 
 
 		 475 aa  46.6  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  29.03 
 
 		 284 aa  46.6  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  32.11 
 
 		 514 aa  46.6  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  38.46 
 
 		 510 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  26.02 
 
 		 271 aa  45.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  26.13 
 
 		 281 aa  45.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  28.68 
 
 		 289 aa  45.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  29.01 
 
 		 305 aa  45.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  28.91 
 
 		 285 aa  45.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  31.93 
 
 		 261 aa  45.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  29.55 
 
 		 541 aa  44.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  33.33 
 
 		 307 aa  45.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  29.73 
 
 		 259 aa  44.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  31.91 
 
 		 276 aa  44.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  30.17 
 
 		 262 aa  44.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  31.91 
 
 		 284 aa  44.3  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  31.91 
 
 		 269 aa  44.3  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>