113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2968 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 284 aa  541  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  47.69 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  48.85 
 
 		 285 aa  202  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  47.46 
 
 		 516 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  47.22 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  51.38 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  45.82 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  44.77 
 
 		 287 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  45.9 
 
 		 273 aa  178  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  47.71 
 
 		 517 aa  175  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  42.64 
 
 		 514 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  45.66 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  42.64 
 
 		 514 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  43.46 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  45.42 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  47.71 
 
 		 517 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  48.15 
 
 		 500 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  40.79 
 
 		 514 aa  165  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  41.64 
 
 		 514 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  45.29 
 
 		 514 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  41.39 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  41.18 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  43.35 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  41.5 
 
 		 492 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  40.08 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  43.15 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  40.31 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  41.84 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  36.44 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  38.63 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  36 
 
 		 262 aa  128  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  36.69 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  38.3 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  39.09 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  37.11 
 
 		 304 aa  116  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  32.67 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  37.98 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  37.07 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  35.34 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  35.65 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  29.91 
 
 		 558 aa  94.4  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  41.67 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  44.53 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  28.21 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  32.2 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  34.58 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  26.22 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  34.53 
 
 		 974 aa  77  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  29.25 
 
 		 551 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  31.78 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  26.26 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  32.52 
 
 		 541 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  30.05 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  35.27 
 
 		 510 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  29.41 
 
 		 533 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  31.96 
 
 		 524 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  25.38 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  31.69 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  37.24 
 
 		 607 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  32.17 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  37.89 
 
 		 678 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  30.22 
 
 		 516 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  28.95 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  27.11 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  31.39 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  30.14 
 
 		 548 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  31.47 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  36.2 
 
 		 475 aa  55.8  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  32.5 
 
 		 674 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  29.1 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  28.87 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  35.86 
 
 		 249 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  26.81 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  28.26 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  34.55 
 
 		 681 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  26.95 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  34.48 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  27.83 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  28.86 
 
 		 502 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  23.49 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  27.83 
 
 		 276 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  24.48 
 
 		 267 aa  49.3  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  27.36 
 
 		 231 aa  48.9  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  30.97 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  26.78 
 
 		 517 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  28.06 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  31.06 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  28.06 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  29.03 
 
 		 752 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  27.27 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  27.78 
 
 		 705 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  27.78 
 
 		 705 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  23.4 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  32.26 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  26.02 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  24.87 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  30.1 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  34.55 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  26.19 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>