55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_22530 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  545  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  59.34 
 
 
270 aa  270  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  50 
 
 
272 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  46.79 
 
 
262 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  43.96 
 
 
261 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  43.81 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  42.72 
 
 
285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  39.81 
 
 
287 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  37.94 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  41.35 
 
 
289 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  38.28 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  42.11 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  36.84 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  36.28 
 
 
287 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  36.46 
 
 
307 aa  105  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  39.64 
 
 
262 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  42.2 
 
 
271 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  39.36 
 
 
287 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  34.94 
 
 
280 aa  99.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  38.82 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  38.54 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  41.67 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  37.21 
 
 
516 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  34.6 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  36.11 
 
 
332 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  33.97 
 
 
310 aa  89  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  31.75 
 
 
316 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  32.23 
 
 
296 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  36.31 
 
 
517 aa  86.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  35.33 
 
 
517 aa  86.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  33.14 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  34.78 
 
 
500 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  33.52 
 
 
514 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  32.86 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  33.15 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  31.02 
 
 
514 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  35.71 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  32.74 
 
 
514 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  30.68 
 
 
514 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  30.68 
 
 
514 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  30.04 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  30.23 
 
 
315 aa  67  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  28.7 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 
304 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  31.09 
 
 
974 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  26.45 
 
 
322 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  27.7 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  30.41 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  31.08 
 
 
260 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  31.54 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  29.37 
 
 
248 aa  46.2  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  21.43 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  29.73 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  29.73 
 
 
259 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  27.34 
 
 
291 aa  42.4  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>