107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1704 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 287 aa  573  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  55.85 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  53.87 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  54.93 
 
 		 285 aa  282  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  52.63 
 
 		 332 aa  271  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  53.33 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  49.61 
 
 		 289 aa  232  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  48.85 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  45.71 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  47.21 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  42.86 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  43.77 
 
 		 281 aa  199  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  43.29 
 
 		 268 aa  195  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  41.79 
 
 		 296 aa  188  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  44.88 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  47.24 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  42.75 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  40.94 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  41.46 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  41.67 
 
 		 516 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  39 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  39.5 
 
 		 261 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  40.15 
 
 		 316 aa  161  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  35.87 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  42.18 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  41.53 
 
 		 517 aa  153  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  39.52 
 
 		 517 aa  152  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  38.4 
 
 		 514 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  37.26 
 
 		 514 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  37.26 
 
 		 514 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  36.02 
 
 		 492 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  37.86 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  38.02 
 
 		 514 aa  145  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  33.7 
 
 		 271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  43.43 
 
 		 514 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  38.92 
 
 		 272 aa  139  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  40.91 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  38.6 
 
 		 500 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  40.47 
 
 		 315 aa  128  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  38.68 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  36.1 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  35.83 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  36.28 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  28.41 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  28.11 
 
 		 558 aa  85.5  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  31.61 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  28.81 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  33.16 
 
 		 541 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  27.88 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  30.7 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  29.15 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  29.63 
 
 		 551 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  26.55 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  26.85 
 
 		 516 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  31.01 
 
 		 759 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  35.9 
 
 		 735 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  30.25 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  27.27 
 
 		 705 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  27.27 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  28.07 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  28.42 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  35.83 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  27.34 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44275  predicted protein  30.23 
 
 		 824 aa  56.2  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  30.53 
 
 		 974 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  30.23 
 
 		 760 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  31.54 
 
 		 752 aa  53.9  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  33.1 
 
 		 502 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  29.55 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  30.05 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  30.43 
 
 		 681 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  28.35 
 
 		 759 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  27.2 
 
 		 759 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  29.66 
 
 		 674 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  36.52 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  32.86 
 
 		 551 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  29.41 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  25.22 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  31.58 
 
 		 678 aa  49.3  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  26.51 
 
 		 278 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  27.01 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  28.83 
 
 		 548 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  32.8 
 
 		 607 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  29.34 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  28.32 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  28.32 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  26.1 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  25.17 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  30.5 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  27.87 
 
 		 759 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  31.87 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  29.01 
 
 		 281 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  28.86 
 
 		 253 aa  45.8  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  29.27 
 
 		 239 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  27.14 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  28.67 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  27.92 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  31.58 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  28.4 
 
 		 544 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1738  Spermidine synthase-like protein  28.32 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>