104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3843 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 544 aa  1106    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  50.36 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  47.32 
 
 		 548 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  47.69 
 
 		 551 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  45.81 
 
 		 516 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  38.31 
 
 		 502 aa  300  5e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  35.29 
 
 		 533 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  31.14 
 
 		 490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  28.85 
 
 		 558 aa  167  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  29.37 
 
 		 541 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  27.67 
 
 		 517 aa  151  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  28.55 
 
 		 510 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  27.75 
 
 		 551 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  28.16 
 
 		 607 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  29.2 
 
 		 524 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  26.61 
 
 		 514 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  26.43 
 
 		 514 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  26.63 
 
 		 514 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  25.45 
 
 		 514 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  37.57 
 
 		 203 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  36.2 
 
 		 220 aa  107  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  26.61 
 
 		 517 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  27.52 
 
 		 517 aa  104  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  25.09 
 
 		 514 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  25 
 
 		 500 aa  97.8  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  30.95 
 
 		 307 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  32.14 
 
 		 334 aa  95.5  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  29.49 
 
 		 974 aa  93.6  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  28.54 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7525  hypothetical protein  36.78 
 
 		 205 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  28.75 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  28.27 
 
 		 830 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  24.4 
 
 		 516 aa  78.2  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  29.66 
 
 		 311 aa  72  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  22.97 
 
 		 782 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  23.9 
 
 		 749 aa  68.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  24.39 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1079 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  23.99 
 
 		 1078 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  22.78 
 
 		 1078 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  23.15 
 
 		 991 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  23.55 
 
 		 835 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  25.96 
 
 		 844 aa  61.6  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  27.54 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  24.61 
 
 		 842 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3413  Spermidine synthase-like protein  26.55 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.730337  normal  0.555353 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3029  hypothetical protein  33.52 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  24.21 
 
 		 837 aa  57  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  23.88 
 
 		 876 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  28.48 
 
 		 286 aa  54.7  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  28.21 
 
 		 322 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  23.16 
 
 		 1017 aa  53.9  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  25.33 
 
 		 326 aa  53.5  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  33.33 
 
 		 231 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  21.71 
 
 		 803 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  29.61 
 
 		 280 aa  53.5  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  31.09 
 
 		 278 aa  51.6  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  32.79 
 
 		 259 aa  51.6  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  32.61 
 
 		 759 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  28.79 
 
 		 1040 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0123  integral membrane protein-like protein  30.37 
 
 		 752 aa  50.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  32.61 
 
 		 759 aa  50.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  32.61 
 
 		 760 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  32.61 
 
 		 759 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  39.34 
 
 		 759 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  28.23 
 
 		 284 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  25.77 
 
 		 257 aa  48.9  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5063  Spermidine synthase-like protein  25.99 
 
 		 692 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  24.22 
 
 		 758 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  30 
 
 		 269 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  30.86 
 
 		 296 aa  48.5  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  30 
 
 		 276 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  23.12 
 
 		 819 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  31.16 
 
 		 283 aa  47.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  30 
 
 		 284 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  22.49 
 
 		 520 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  26.75 
 
 		 280 aa  47.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  22.13 
 
 		 523 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2698  putative transporter  30.43 
 
 		 744 aa  47  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  29.46 
 
 		 279 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  23.49 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  26.56 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  23.49 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  26.97 
 
 		 310 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  27.05 
 
 		 304 aa  45.8  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  27.1 
 
 		 286 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  27.17 
 
 		 276 aa  45.8  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  23.74 
 
 		 304 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  25.57 
 
 		 522 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  25.32 
 
 		 251 aa  45.4  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  24.64 
 
 		 536 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  24.6 
 
 		 255 aa  44.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  27.87 
 
 		 674 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  25.31 
 
 		 520 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  25.31 
 
 		 520 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  28.95 
 
 		 316 aa  44.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  31.52 
 
 		 903 aa  44.3  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  28.1 
 
 		 274 aa  43.9  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  25.64 
 
 		 258 aa  43.9  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  26.9 
 
 		 283 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>