94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1526 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  48.14 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  47.49 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  46.95 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  44.24 
 
 		 281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  45.45 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  45.08 
 
 		 285 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  39.79 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  38.91 
 
 		 316 aa  195  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  43.73 
 
 		 287 aa  195  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  49.34 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  45.39 
 
 		 280 aa  189  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  41.89 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  41.79 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  41.98 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  45.85 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  43.51 
 
 		 516 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  42.86 
 
 		 276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  40.99 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  42.62 
 
 		 262 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  40 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  44.84 
 
 		 500 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  40 
 
 		 268 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  39.61 
 
 		 514 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  39.61 
 
 		 514 aa  155  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  39.36 
 
 		 492 aa  155  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  40 
 
 		 514 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  41.77 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  39.6 
 
 		 517 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  38.43 
 
 		 514 aa  153  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  38.43 
 
 		 514 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  41.2 
 
 		 517 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  38.71 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  43.35 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  38.18 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  38.5 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  32.85 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  32.49 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  32.64 
 
 		 261 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  40.19 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  33.03 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  40.65 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  33.18 
 
 		 270 aa  97.4  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  32.23 
 
 		 286 aa  89  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  33.06 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  33.51 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  24.7 
 
 		 558 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  27.44 
 
 		 311 aa  75.5  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  28 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  26.7 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  24.47 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  27.47 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  34 
 
 		 475 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  28.65 
 
 		 551 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  30.17 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  31.47 
 
 		 551 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  29.69 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  30.05 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  31.93 
 
 		 705 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  31.93 
 
 		 705 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  35.92 
 
 		 502 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  27.37 
 
 		 541 aa  55.8  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  29.84 
 
 		 490 aa  55.8  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  32.21 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  36.36 
 
 		 678 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  30.83 
 
 		 759 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  29.17 
 
 		 516 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  28 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  28.93 
 
 		 548 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  31 
 
 		 759 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  31.96 
 
 		 752 aa  50.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  26.28 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  28.46 
 
 		 974 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  29.63 
 
 		 544 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  24.58 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  25.11 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  24.24 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  29.29 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  29.19 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  29.29 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  29.41 
 
 		 759 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  29.29 
 
 		 269 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  23.53 
 
 		 533 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  29.17 
 
 		 760 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  30.25 
 
 		 759 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  32.22 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  26.28 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  26.28 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  25.35 
 
 		 259 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  28.95 
 
 		 510 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  27.08 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  25 
 
 		 278 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  30.09 
 
 		 674 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  29.17 
 
 		 253 aa  42.7  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>