47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1508 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  100 
 
 		 674 aa  1349    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  46.2 
 
 		 678 aa  525  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  47.88 
 
 		 681 aa  508  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  35.27 
 
 		 752 aa  361  3e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2560  hypothetical protein  34.16 
 
 		 789 aa  323  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0123  integral membrane protein-like protein  46.86 
 
 		 752 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2698  putative transporter  35.55 
 
 		 744 aa  289  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  30.57 
 
 		 705 aa  278  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  30.43 
 
 		 705 aa  276  8e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  41.18 
 
 		 759 aa  232  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  39.08 
 
 		 759 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  41.64 
 
 		 735 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  41.71 
 
 		 759 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  39.63 
 
 		 760 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  40.82 
 
 		 759 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0691  hypothetical protein  27.6 
 
 		 791 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140408  normal  0.176314 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  32.17 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  23.57 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  31.93 
 
 		 272 aa  55.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  33.33 
 
 		 500 aa  54.7  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  32.5 
 
 		 284 aa  54.7  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  26.84 
 
 		 267 aa  54.7  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  33.07 
 
 		 492 aa  55.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  34.23 
 
 		 248 aa  53.9  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  30.77 
 
 		 516 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04663  spermine/spermidine synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08500)  27.6 
 
 		 558 aa  52  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725678  normal  0.343569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4279  hypothetical protein  33.93 
 
 		 818 aa  52  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  28.25 
 
 		 261 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  30.51 
 
 		 502 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  33.12 
 
 		 516 aa  48.9  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  30.33 
 
 		 514 aa  47.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  30.33 
 
 		 514 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  28.69 
 
 		 514 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  28.69 
 
 		 514 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  29.33 
 
 		 268 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  31.71 
 
 		 281 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  28.81 
 
 		 287 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  26.45 
 
 		 220 aa  46.2  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  30.51 
 
 		 517 aa  45.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  27.54 
 
 		 322 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  27.87 
 
 		 544 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  31.65 
 
 		 304 aa  45.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  34.94 
 
 		 307 aa  45.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  28.24 
 
 		 558 aa  44.7  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  31.01 
 
 		 203 aa  44.3  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  27.87 
 
 		 514 aa  43.9  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  29.71 
 
 		 276 aa  43.9  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>