98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2683 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 281 aa  546  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  71.32 
 
 		 273 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  54.58 
 
 		 287 aa  285  5e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  50.57 
 
 		 289 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  50.75 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  47.58 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  49.05 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  47.37 
 
 		 285 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  44.19 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  46.9 
 
 		 307 aa  205  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  43.77 
 
 		 287 aa  198  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  42.38 
 
 		 332 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  42.86 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  42.54 
 
 		 273 aa  185  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  41.83 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  35.91 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  45.66 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  41.34 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  37.36 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  41.05 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  41.18 
 
 		 516 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  39.19 
 
 		 268 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  40.89 
 
 		 492 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  43.24 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  37.55 
 
 		 514 aa  148  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  38.1 
 
 		 514 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  41.67 
 
 		 517 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  36.64 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  37.55 
 
 		 514 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  43.06 
 
 		 500 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  36.51 
 
 		 514 aa  142  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  40.62 
 
 		 514 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  34.31 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  39.75 
 
 		 517 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  41.47 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  36.49 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  35.71 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  35.84 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  35.37 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  36.21 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  36.97 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  36.54 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  29.21 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  36.49 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  30.89 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  26.7 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  23.89 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  30.36 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  31.13 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  34.17 
 
 		 974 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  34.21 
 
 		 516 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  30.67 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  27.23 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  28.86 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  27.51 
 
 		 490 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  30.77 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  28.28 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  29.63 
 
 		 705 aa  53.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  29.46 
 
 		 334 aa  53.1  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  29.63 
 
 		 705 aa  53.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  26.09 
 
 		 551 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  30.46 
 
 		 510 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  30.77 
 
 		 248 aa  52.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  23.35 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  28.12 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  28.99 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  26.28 
 
 		 533 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  27.4 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  29.68 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  28.28 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  30 
 
 		 502 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  29.68 
 
 		 251 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  26.77 
 
 		 276 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  26.44 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  23.98 
 
 		 752 aa  48.9  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  27.74 
 
 		 253 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  26.77 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  28.66 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  26.77 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  26.71 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  28.39 
 
 		 541 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  31.71 
 
 		 674 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  29.87 
 
 		 475 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  27.97 
 
 		 275 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  27.15 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  25.95 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  27.52 
 
 		 678 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  24.66 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  33.61 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  33.61 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  31.53 
 
 		 517 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  28.21 
 
 		 759 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  29.06 
 
 		 759 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04663  spermine/spermidine synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08500)  26.02 
 
 		 558 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725678  normal  0.343569 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  26.04 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  27.97 
 
 		 759 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  28.81 
 
 		 760 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  26.39 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>