79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3103 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 280 aa  553  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  53.93 
 
 		 310 aa  265  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  52 
 
 		 316 aa  262  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  46.85 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  50.78 
 
 		 304 aa  205  8e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  44.74 
 
 		 285 aa  188  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  45.06 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  45.49 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  44.49 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  43.8 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  44.88 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  49.34 
 
 		 320 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  42.52 
 
 		 304 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  43.43 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  41.87 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  41.32 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  39.22 
 
 		 273 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  36.64 
 
 		 281 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  38.37 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  36.47 
 
 		 332 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  37.08 
 
 		 273 aa  138  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  36.11 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  37.8 
 
 		 268 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  36.21 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  35.71 
 
 		 517 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  34.11 
 
 		 261 aa  118  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  33.05 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  39.58 
 
 		 516 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  38.3 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  32.51 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  37.29 
 
 		 517 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  37.5 
 
 		 500 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  35.24 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  34.43 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  34.62 
 
 		 514 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  34.62 
 
 		 514 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  34.13 
 
 		 514 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  34.31 
 
 		 514 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  34.94 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  33.65 
 
 		 514 aa  99  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  33.04 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  34.38 
 
 		 492 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  36.06 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  32.37 
 
 		 266 aa  85.5  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  38.81 
 
 		 502 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  24.49 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  28.99 
 
 		 974 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  30.34 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  27.96 
 
 		 516 aa  62.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  24.18 
 
 		 558 aa  62.8  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  31.65 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  31.65 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  33.8 
 
 		 548 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  26.62 
 
 		 533 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  29.61 
 
 		 544 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  27.94 
 
 		 490 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04663  spermine/spermidine synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08500)  31.47 
 
 		 558 aa  52.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725678  normal  0.343569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  30.3 
 
 		 551 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44275  predicted protein  29.19 
 
 		 824 aa  52.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  29.73 
 
 		 334 aa  52.4  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  27.54 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  27.89 
 
 		 541 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  29.56 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  27.92 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  30.67 
 
 		 551 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  26.09 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  29.45 
 
 		 259 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  25.87 
 
 		 551 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  27.04 
 
 		 275 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  28.18 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  22.71 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  26.55 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  26.06 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  29.36 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  27.78 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  29.07 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  23.27 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  28.08 
 
 		 253 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  34.34 
 
 		 475 aa  42.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>