134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3177 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 548 aa  1095    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  86.21 
 
 		 551 aa  921    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  56.98 
 
 		 551 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  47.69 
 
 		 544 aa  446  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  44.23 
 
 		 516 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  37.71 
 
 		 502 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  33.08 
 
 		 533 aa  251  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  33.58 
 
 		 490 aa  199  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  29.07 
 
 		 558 aa  178  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  31.01 
 
 		 607 aa  161  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  29.93 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  28.12 
 
 		 541 aa  146  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  30.11 
 
 		 524 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  29.87 
 
 		 517 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  30.19 
 
 		 514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  30.31 
 
 		 514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  30.15 
 
 		 514 aa  120  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  26.86 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  30.02 
 
 		 514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  30.02 
 
 		 514 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  32.93 
 
 		 307 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  38.1 
 
 		 203 aa  104  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  29.37 
 
 		 516 aa  103  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  30.09 
 
 		 517 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  27.29 
 
 		 471 aa  98.6  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  31.58 
 
 		 492 aa  97.1  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  27.13 
 
 		 500 aa  95.9  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  27.95 
 
 		 334 aa  95.9  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  27.97 
 
 		 517 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7525  hypothetical protein  37.63 
 
 		 205 aa  88.6  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  27.64 
 
 		 1078 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  27.43 
 
 		 1078 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  31.1 
 
 		 220 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1079 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  26.24 
 
 		 842 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  30.73 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  27.74 
 
 		 974 aa  79.3  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  24.95 
 
 		 835 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3029  hypothetical protein  34.48 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  27.22 
 
 		 982 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  27.35 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  25.09 
 
 		 830 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  30.94 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  23.09 
 
 		 749 aa  67  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  28.26 
 
 		 307 aa  62  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  27.4 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  24.2 
 
 		 782 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  26.71 
 
 		 475 aa  60.1  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  24.24 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0159  hypothetical protein  31.22 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0669306  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04883  putative integral membrane protein  29.63 
 
 		 494 aa  57  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  31.62 
 
 		 705 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  31.62 
 
 		 705 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  24.46 
 
 		 1017 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  25.65 
 
 		 759 aa  55.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  27.22 
 
 		 259 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  35.48 
 
 		 523 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 304 aa  55.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  33.8 
 
 		 280 aa  55.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  26.22 
 
 		 267 aa  54.7  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  29.48 
 
 		 268 aa  54.7  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  31.08 
 
 		 304 aa  54.3  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  24.11 
 
 		 876 aa  53.9  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  26.27 
 
 		 520 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  30.39 
 
 		 983 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  26.28 
 
 		 264 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  26.28 
 
 		 264 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  29.89 
 
 		 316 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  29.08 
 
 		 520 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  24.36 
 
 		 504 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  29.5 
 
 		 757 aa  52.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  29.08 
 
 		 520 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  24.58 
 
 		 504 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  23.97 
 
 		 536 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  24.03 
 
 		 504 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  24.03 
 
 		 504 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  24.03 
 
 		 504 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  30.26 
 
 		 248 aa  51.6  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  23.36 
 
 		 837 aa  51.6  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  30.4 
 
 		 231 aa  51.6  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  28.93 
 
 		 251 aa  51.6  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  24.15 
 
 		 844 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  29.31 
 
 		 269 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  29.31 
 
 		 276 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  28.93 
 
 		 296 aa  50.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  26.62 
 
 		 275 aa  50.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  29.31 
 
 		 284 aa  50.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  31.36 
 
 		 1040 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  22.58 
 
 		 508 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  27.21 
 
 		 277 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  30.07 
 
 		 310 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  30.14 
 
 		 284 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  23.16 
 
 		 503 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  31.09 
 
 		 752 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  29.09 
 
 		 310 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  30.39 
 
 		 315 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  30.25 
 
 		 274 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  25.52 
 
 		 270 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  30.82 
 
 		 285 aa  48.5  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  33.62 
 
 		 283 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>