84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1061 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  607  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  46.34 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  44.77 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  36.95 
 
 		 304 aa  175  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  35.1 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  32.19 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  33.94 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  32.85 
 
 		 296 aa  139  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  33.96 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  31.64 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  33.21 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  36.11 
 
 		 280 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  36.09 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  31.43 
 
 		 273 aa  122  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  33.58 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  29.93 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  28.83 
 
 		 289 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  31.95 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  30.25 
 
 		 517 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  34.52 
 
 		 517 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  29 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  28.74 
 
 		 268 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  33.51 
 
 		 500 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  28.46 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  29.56 
 
 		 261 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  26.37 
 
 		 266 aa  95.9  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  28.16 
 
 		 516 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  28.41 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  28.72 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  27.44 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  29.24 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  33.86 
 
 		 492 aa  87  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  28.57 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  25.09 
 
 		 514 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  29.63 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  26.69 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  25.09 
 
 		 514 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  25.09 
 
 		 514 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  30.37 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  24.82 
 
 		 514 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  25.85 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  30.26 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  29.14 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  28.7 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  25.36 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  25.36 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  25.42 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  25.42 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  25.42 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  25.3 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  23.68 
 
 		 558 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  25 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  28.91 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  28.91 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  26.8 
 
 		 281 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  30.43 
 
 		 248 aa  52.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  26.15 
 
 		 284 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  26.77 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  26.77 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  29.32 
 
 		 502 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  25 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2801  spermine synthase  26.42 
 
 		 221 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  28.57 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  24.18 
 
 		 247 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  26.63 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  23.84 
 
 		 247 aa  49.3  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  24.18 
 
 		 247 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  23.84 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  24.29 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  27.34 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  27.37 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  26.4 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  24.85 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  30.43 
 
 		 231 aa  45.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  26.09 
 
 		 516 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  26.35 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  26.26 
 
 		 974 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  21.74 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  22.84 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  26.62 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  21.71 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  25 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  24.04 
 
 		 533 aa  42.7  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  24.44 
 
 		 253 aa  42.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>