114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2801 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2801  spermine synthase  100 
 
 		 221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  33.64 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  34.26 
 
 		 516 aa  62.8  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  34.78 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  28.97 
 
 		 277 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2629  hypothetical protein  24.84 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1760  hypothetical protein  39.76 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  27.68 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  27.56 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  27.78 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  27.56 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  27.78 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  27.78 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  30.51 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  28.57 
 
 		 277 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  29.46 
 
 		 279 aa  52  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  31.9 
 
 		 283 aa  51.6  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  25.98 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  25.98 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  36.7 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  26.77 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  22.22 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  25.98 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  28.99 
 
 		 296 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  28.99 
 
 		 296 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  31.9 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  26.42 
 
 		 301 aa  49.3  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  31.3 
 
 		 287 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  28.99 
 
 		 296 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  28.85 
 
 		 334 aa  49.3  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  28.83 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  25.23 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  27.27 
 
 		 286 aa  49.3  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  32.76 
 
 		 558 aa  48.9  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  28.26 
 
 		 287 aa  48.5  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  27.52 
 
 		 247 aa  48.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  29.09 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  30.08 
 
 		 533 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  30.7 
 
 		 301 aa  47  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  26.36 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  27.93 
 
 		 283 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  26.67 
 
 		 304 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  28.4 
 
 		 307 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  23.44 
 
 		 271 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  25.21 
 
 		 315 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  26.79 
 
 		 280 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  27.43 
 
 		 275 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  24.78 
 
 		 278 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  30.91 
 
 		 310 aa  45.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1532  putative spermidine synthase  26.17 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.218383  normal  0.14893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  25.45 
 
 		 286 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  21.57 
 
 		 289 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15982  predicted protein  22.98 
 
 		 332 aa  45.1  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283158  normal  0.0285818 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04663  spermine/spermidine synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08500)  33.33 
 
 		 558 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725678  normal  0.343569 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  28.7 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  22.81 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  25.23 
 
 		 274 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  22.89 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  26.36 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  27.01 
 
 		 541 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  25.89 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  24.82 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  25.89 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  26.36 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  29.66 
 
 		 288 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  27.83 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  29.66 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  29.66 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  27.27 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1916  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 291 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  25.23 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  26.85 
 
 		 521 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  26.79 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  29.66 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  29.66 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  29.66 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  29.66 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  28.78 
 
 		 286 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  29.66 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  29.66 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  28.8 
 
 		 287 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3461  spermidine synthase  32.97 
 
 		 278 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  29.63 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  25.38 
 
 		 286 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0927  spermine synthase  28.43 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  28.78 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  28.78 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  28.78 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  28.78 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  26.72 
 
 		 313 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  30.86 
 
 		 510 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  26.85 
 
 		 510 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  31.87 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  27.54 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1674  hypothetical protein  28.92 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0154  spermidine synthase  27.27 
 
 		 285 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3567  spermidine synthase  31.87 
 
 		 275 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  23.26 
 
 		 544 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  26.14 
 
 		 308 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>