35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1532 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1532  putative spermidine synthase  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.218383  normal  0.14893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  30.23 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  33.64 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0482  hypothetical protein  28.07 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2629  hypothetical protein  29.02 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  32.73 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  29.51 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  29.79 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  29.51 
 
 		 541 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  30.37 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  30.37 
 
 		 278 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  30.56 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  29.01 
 
 		 322 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  23.33 
 
 		 558 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  33.33 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  27.82 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  32 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  27.41 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1760  hypothetical protein  28.68 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  30.6 
 
 		 284 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  29.07 
 
 		 551 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  27.17 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  30.6 
 
 		 276 aa  45.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  28.89 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2801  spermine synthase  26.17 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  30.6 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  28.15 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  30.65 
 
 		 502 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  24.79 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  22.99 
 
 		 533 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  26.15 
 
 		 334 aa  43.5  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  28.79 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  28.99 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  23.36 
 
 		 247 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>