More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1135 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  100 
 
 
558 aa  1124    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  34.78 
 
 
551 aa  295  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  33.08 
 
 
541 aa  284  3.0000000000000004e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  33.54 
 
 
490 aa  259  9e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  31.21 
 
 
516 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  32.12 
 
 
502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  30.87 
 
 
510 aa  206  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  29.71 
 
 
524 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  29.29 
 
 
607 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  30.02 
 
 
551 aa  196  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  29.23 
 
 
551 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  28.65 
 
 
548 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  31.07 
 
 
533 aa  176  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  28.6 
 
 
544 aa  173  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  28.82 
 
 
514 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  28.18 
 
 
514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  28.18 
 
 
514 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  27.98 
 
 
517 aa  155  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  27.63 
 
 
514 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  27.2 
 
 
514 aa  154  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  29.25 
 
 
500 aa  153  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  27.26 
 
 
492 aa  151  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  28.32 
 
 
517 aa  150  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  28.16 
 
 
517 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  27.2 
 
 
516 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  37.17 
 
 
203 aa  120  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  29.63 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  27.15 
 
 
307 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  26.84 
 
 
749 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  23.12 
 
 
1078 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  22.13 
 
 
1078 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  34.53 
 
 
248 aa  104  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  30.88 
 
 
308 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  22.15 
 
 
1079 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  32.91 
 
 
220 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  23.64 
 
 
844 aa  101  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  29 
 
 
322 aa  98.2  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  28.52 
 
 
339 aa  92  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  23.49 
 
 
782 aa  90.9  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7525  hypothetical protein  32.96 
 
 
205 aa  89.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  28.18 
 
 
974 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  23.18 
 
 
983 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  29.91 
 
 
284 aa  85.9  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  22.5 
 
 
982 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  20.79 
 
 
1017 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  28.15 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  32.9 
 
 
277 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  21.16 
 
 
876 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  24.54 
 
 
307 aa  82  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  24.42 
 
 
471 aa  81.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  22.34 
 
 
835 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  28.5 
 
 
273 aa  79  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  24.7 
 
 
296 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  31.68 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  21.7 
 
 
836 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  31.36 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  28.11 
 
 
287 aa  77  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  32.72 
 
 
289 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  28.93 
 
 
249 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  22.36 
 
 
842 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  30.36 
 
 
268 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  24.44 
 
 
285 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  30.67 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  32.39 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  27.93 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  22.64 
 
 
758 aa  74.3  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  22.47 
 
 
837 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  26.15 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  26.15 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  22.71 
 
 
830 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  31.47 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  26.64 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  30.99 
 
 
284 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  28.43 
 
 
249 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  25.81 
 
 
304 aa  72.8  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  23.79 
 
 
285 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  24.86 
 
 
287 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  30.92 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  30.92 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  28.03 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  28.32 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  28.32 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  29.94 
 
 
281 aa  69.3  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  24.7 
 
 
765 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  24.91 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  25.53 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  37.19 
 
 
705 aa  67.8  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  26.63 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  37.19 
 
 
705 aa  67.4  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  26.73 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  23.39 
 
 
475 aa  67.4  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  27.78 
 
 
251 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  26.26 
 
 
287 aa  67  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  27.72 
 
 
284 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  27.06 
 
 
757 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  26.05 
 
 
310 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  28.12 
 
 
271 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  25.98 
 
 
251 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>