273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5699 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  100 
 
 		 278 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  81.11 
 
 		 271 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  72.66 
 
 		 274 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  53.61 
 
 		 282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  52.43 
 
 		 278 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  52.43 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  50.19 
 
 		 278 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  50.19 
 
 		 278 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  52.48 
 
 		 257 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  52.77 
 
 		 239 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  52.52 
 
 		 269 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  52.52 
 
 		 276 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  52.52 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  52.31 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  46.28 
 
 		 264 aa  208  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  46.28 
 
 		 264 aa  208  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  49 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  49 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  44.22 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  39.69 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  38.8 
 
 		 277 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  35.54 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  40.95 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  40.95 
 
 		 253 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  41.99 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  43.94 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  38.24 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  38.59 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  33.33 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  37.05 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  33.33 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  32.31 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  31.9 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  32.35 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  32.35 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  30.73 
 
 		 259 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  28.88 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  32.29 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  32.4 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  32.78 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  31.22 
 
 		 364 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  32.78 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  32.78 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  30.54 
 
 		 387 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  30.54 
 
 		 309 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  30.54 
 
 		 398 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  29.96 
 
 		 309 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  30.38 
 
 		 310 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  29.96 
 
 		 309 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  29.96 
 
 		 309 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  32.4 
 
 		 305 aa  95.5  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  29.96 
 
 		 387 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  31.86 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  34.47 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  27.51 
 
 		 307 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  33.73 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  29.88 
 
 		 310 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  28.04 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  29.86 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  29.46 
 
 		 310 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  30.49 
 
 		 305 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  27.34 
 
 		 273 aa  88.6  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  28.1 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  27.69 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2311  spermidine synthase-like protein  33.03 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  29.86 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  32.52 
 
 		 322 aa  85.9  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  35.63 
 
 		 255 aa  85.5  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  30.4 
 
 		 255 aa  85.5  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  30.32 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  30.46 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  36.78 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  31.36 
 
 		 558 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  26.29 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  28.64 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  34.43 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  34.93 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  27.45 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  32.69 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  30.85 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  28.77 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  28.77 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  30.35 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3059  spermidine synthase-like protein  26.96 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110993  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  26.13 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  31.76 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  29.23 
 
 		 541 aa  65.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  28.43 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  30.86 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  30.82 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  30.3 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  32.82 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0335  spermidine synthase  36.51 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  28.43 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  32.82 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0156  spermidine synthase  36.72 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  27.38 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  29.02 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  37.12 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  28.57 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>