249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0248 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  100 
 
 		 308 aa  634    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  30.63 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  30.43 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  28.89 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  27.89 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  32.27 
 
 		 261 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  30 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  30.88 
 
 		 558 aa  105  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  27.14 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  31.9 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  27.23 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  29.7 
 
 		 277 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  33.7 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  31.68 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  27.19 
 
 		 231 aa  99.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  29.21 
 
 		 274 aa  95.9  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  25.35 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  27.17 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  27.17 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  25.63 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  27.32 
 
 		 281 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  31.98 
 
 		 255 aa  92.8  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  26.78 
 
 		 239 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  29.34 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  25.84 
 
 		 276 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  25.84 
 
 		 284 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  28.07 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  28.86 
 
 		 253 aa  90.1  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  25.36 
 
 		 269 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  28.48 
 
 		 282 aa  89  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  30.67 
 
 		 247 aa  89.4  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  28.57 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  26.59 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  26.59 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  30.22 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  27.67 
 
 		 249 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  28.28 
 
 		 516 aa  85.5  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  26.48 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  27.57 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  26.48 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  26.5 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  26.21 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  26.18 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  26.13 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  28.65 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  27.33 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  27.33 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0927  spermine synthase  31.94 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  25.65 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  25.65 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  26.57 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  24.87 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  24.17 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  28.82 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  28.02 
 
 		 502 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  28.21 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2160  spermine synthase  28.92 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55651  normal  0.223021 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  26.21 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  26.7 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  26.7 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  26.7 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  26.7 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  22.41 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  30.99 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  24.29 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  25.49 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  23.39 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  23.39 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  23.39 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  23.39 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  23.39 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  28.95 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  30.09 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  26.35 
 
 		 516 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  24.86 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  23.22 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0745  spermine synthase  28.8 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  27.14 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  23.67 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  26.36 
 
 		 541 aa  73.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  23.22 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  22.9 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  22.9 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  22.9 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  22.9 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  23.22 
 
 		 387 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  23.33 
 
 		 251 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  33.09 
 
 		 533 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  22.71 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04883  putative integral membrane protein  25.12 
 
 		 494 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  23.33 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  23.15 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  26.32 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  27.1 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  25.26 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  23.39 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  23.7 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  26.76 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  24.88 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  30.94 
 
 		 548 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>