92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1946 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 282 aa  558  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  44.66 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  45.06 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  42.29 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  40.89 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  42.86 
 
 		 281 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  39.85 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  35.87 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  41.11 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  37.5 
 
 		 516 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  40.47 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  38.5 
 
 		 296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  41.01 
 
 		 500 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  40.31 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  37.2 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  32.62 
 
 		 514 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  32.62 
 
 		 514 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  32.98 
 
 		 514 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  34.78 
 
 		 514 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  34.83 
 
 		 307 aa  135  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  37.21 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  36.63 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  35.16 
 
 		 517 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  35.97 
 
 		 332 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  32.89 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  31.91 
 
 		 514 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  33.2 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  33.99 
 
 		 273 aa  125  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  37.91 
 
 		 304 aa  125  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  36.61 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  37.61 
 
 		 517 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  39.52 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  40.36 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  34.72 
 
 		 492 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  31.82 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  32.88 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  34.43 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  33.92 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  35.43 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  29.24 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  34.84 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  26.57 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  35.95 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  35.71 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  31.61 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  32.43 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  31.35 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  21.84 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  33.33 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  26.4 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  29.95 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  33.52 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  31.08 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  32.12 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  29.37 
 
 		 502 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  31.87 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  31.19 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  29.08 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  32.12 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  32.31 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  24.5 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  31.21 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  24.71 
 
 		 339 aa  52.8  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  31.65 
 
 		 261 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  30.72 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  26.49 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  27.27 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  30.56 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  24.03 
 
 		 551 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  29.07 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  27.27 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  28.07 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  28.65 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  24.84 
 
 		 541 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  33.33 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  28.65 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  25.12 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  32.61 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  26.87 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  25.7 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  30.81 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  33.08 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  23.56 
 
 		 533 aa  47  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  28.15 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3123  spermidine synthase  29.22 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  28.66 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  28.8 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  36.36 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  26.71 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  30.56 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  26.24 
 
 		 974 aa  42.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>