97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2508 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  519  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  78.57 
 
 		 262 aa  400  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  44.76 
 
 		 272 aa  194  9e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  48.57 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  43.16 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  43.96 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  44.02 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  39.5 
 
 		 287 aa  168  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  44.08 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  40.34 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  39.5 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  41.81 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  38.08 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  35.62 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  36.44 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  39.59 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  35.85 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  32.64 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  34.47 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  36.02 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  35.84 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  32.63 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  36.69 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  34.07 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  33.05 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  31.53 
 
 		 316 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  34.23 
 
 		 517 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  33.77 
 
 		 516 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  35.14 
 
 		 517 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  31.67 
 
 		 492 aa  105  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  34.08 
 
 		 320 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  32.88 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  32.27 
 
 		 500 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  32.7 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  33.49 
 
 		 266 aa  101  9e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  33.18 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  30.74 
 
 		 315 aa  92.4  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  31.49 
 
 		 514 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  28.57 
 
 		 514 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  28.57 
 
 		 514 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  29.28 
 
 		 514 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  29.67 
 
 		 514 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  25.85 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  28.34 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  22.27 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  25.6 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  23.66 
 
 		 516 aa  55.8  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  28.98 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  33.04 
 
 		 551 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  28.41 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  28.41 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  31.67 
 
 		 974 aa  52.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  25 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  25.77 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44275  predicted protein  26.44 
 
 		 824 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  27.01 
 
 		 533 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  28.98 
 
 		 282 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  27.1 
 
 		 307 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  31.58 
 
 		 262 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  28.66 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  25.26 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  22.89 
 
 		 551 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  26.71 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  27.8 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  26.7 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  24.1 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  30.72 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  25.17 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  25.17 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  30.41 
 
 		 502 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  26.14 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06771  hypothetical protein  39.29 
 
 		 297 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  32.9 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  32.03 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  25.17 
 
 		 281 aa  45.4  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  32.47 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  31.93 
 
 		 752 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  25.26 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  25.26 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  22.45 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  19.69 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  23.74 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  30.63 
 
 		 678 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  30.43 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  27.78 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  26.67 
 
 		 759 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  24.49 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  27.87 
 
 		 334 aa  43.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  33.12 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  28.17 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1130  hypothetical protein  41.07 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.398385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  26.01 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0482  hypothetical protein  27.68 
 
 		 211 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10381  hypothetical protein  33.93 
 
 		 187 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  25.32 
 
 		 304 aa  42  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0612  hypothetical protein  35.71 
 
 		 301 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>