66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1694 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  100 
 
 		 678 aa  1368    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  45.83 
 
 		 681 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  46.35 
 
 		 674 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0123  integral membrane protein-like protein  41.41 
 
 		 752 aa  495  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  34.71 
 
 		 759 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2560  hypothetical protein  35.24 
 
 		 789 aa  354  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  35.14 
 
 		 760 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  35.07 
 
 		 759 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  34.81 
 
 		 735 aa  343  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  34.24 
 
 		 759 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  30.62 
 
 		 705 aa  303  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  30.48 
 
 		 705 aa  301  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2698  putative transporter  34.68 
 
 		 744 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  39.33 
 
 		 759 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  38.76 
 
 		 752 aa  213  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0691  hypothetical protein  33.33 
 
 		 791 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140408  normal  0.176314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  42.11 
 
 		 492 aa  70.5  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  33.93 
 
 		 268 aa  66.6  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  37.89 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  35.78 
 
 		 311 aa  63.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  37.72 
 
 		 255 aa  59.3  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  37.89 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  24.61 
 
 		 533 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  24.79 
 
 		 517 aa  56.6  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  36.17 
 
 		 514 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  37.23 
 
 		 514 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  25.84 
 
 		 307 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  39.08 
 
 		 514 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  39.08 
 
 		 514 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  35.11 
 
 		 514 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  31.58 
 
 		 517 aa  52  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  35.35 
 
 		 516 aa  52.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  27.1 
 
 		 516 aa  52.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  30.38 
 
 		 272 aa  52.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  36.36 
 
 		 296 aa  52  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  37.74 
 
 		 475 aa  51.2  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  29.82 
 
 		 289 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  35.96 
 
 		 551 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  33.91 
 
 		 502 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15982  predicted protein  32.03 
 
 		 332 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283158  normal  0.0285818 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04663  spermine/spermidine synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08500)  28.1 
 
 		 558 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725678  normal  0.343569 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  31.13 
 
 		 558 aa  48.9  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  25.81 
 
 		 264 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  25.81 
 
 		 264 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  27.01 
 
 		 305 aa  46.6  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  31.48 
 
 		 267 aa  47  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  30.91 
 
 		 248 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  30.7 
 
 		 287 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  32.18 
 
 		 262 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  30 
 
 		 261 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  33.53 
 
 		 490 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  34.23 
 
 		 284 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  24.57 
 
 		 322 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 304 aa  45.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  34.23 
 
 		 276 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  31.4 
 
 		 548 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  34.23 
 
 		 269 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4279  hypothetical protein  29.55 
 
 		 818 aa  45.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  28.32 
 
 		 304 aa  45.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  30.7 
 
 		 517 aa  45.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  30.12 
 
 		 541 aa  45.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  27.52 
 
 		 281 aa  45.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  26.53 
 
 		 257 aa  44.3  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  28.12 
 
 		 287 aa  44.3  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  29.13 
 
 		 332 aa  44.3  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  30.12 
 
 		 551 aa  44.3  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>