101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1355 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 332 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  57.36 
 
 		 287 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  53.38 
 
 		 287 aa  278  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  49.81 
 
 		 285 aa  252  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  50.57 
 
 		 276 aa  249  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  50.19 
 
 		 289 aa  248  8e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  49.06 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  45.83 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  44.27 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  43.77 
 
 		 287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  42.7 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  42.92 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  40 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  41.73 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  40.64 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  43.1 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  41.81 
 
 		 261 aa  176  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  38.49 
 
 		 261 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  43.15 
 
 		 284 aa  165  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  40.6 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  36.67 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  36.72 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  40.95 
 
 		 516 aa  159  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  36.05 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  36.47 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  36.5 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  35.97 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  39.07 
 
 		 500 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  38.55 
 
 		 517 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  36.55 
 
 		 517 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  33.46 
 
 		 514 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  33.46 
 
 		 514 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  34.38 
 
 		 514 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  33.59 
 
 		 514 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  36.84 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  33.58 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  33.59 
 
 		 514 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  37.34 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  34.91 
 
 		 492 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  37.56 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  34.57 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  34.57 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  35.91 
 
 		 315 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  36.11 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  26.37 
 
 		 558 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  22.97 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  33.61 
 
 		 974 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  29.59 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  28.37 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  29.45 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  30.65 
 
 		 759 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  30.72 
 
 		 510 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  26.98 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  28.77 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  24.34 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  24.6 
 
 		 551 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  27.75 
 
 		 249 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  29.51 
 
 		 752 aa  52.8  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  31.25 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  29.46 
 
 		 759 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  26.42 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  22.28 
 
 		 516 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  27.69 
 
 		 759 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  27.75 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  28.67 
 
 		 678 aa  50.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  29.03 
 
 		 760 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  22.44 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44275  predicted protein  27.23 
 
 		 824 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  26.87 
 
 		 533 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  25.53 
 
 		 541 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  28.08 
 
 		 267 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  27.91 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  30.33 
 
 		 681 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  27.46 
 
 		 277 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  24.49 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  26.67 
 
 		 705 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  27.87 
 
 		 759 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  26.67 
 
 		 705 aa  46.2  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  23.37 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  23.37 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  23.37 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  23.37 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  31.14 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  23.08 
 
 		 281 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  28.78 
 
 		 551 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  28.08 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  23.2 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  24.5 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  27.22 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  28.17 
 
 		 674 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  30.41 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  27.8 
 
 		 502 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  21.34 
 
 		 276 aa  43.5  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  25.6 
 
 		 253 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  23.37 
 
 		 247 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  23.37 
 
 		 247 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  23.37 
 
 		 261 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  23.37 
 
 		 261 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  27.4 
 
 		 278 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  27.4 
 
 		 278 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>