88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7684 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  535  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  71.32 
 
 		 281 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  57.89 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  52.26 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  50.19 
 
 		 285 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  50 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  49.05 
 
 		 289 aa  234  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  46.82 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  46.59 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  47.21 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  43.77 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  45.19 
 
 		 273 aa  196  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  43.43 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  42.08 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  41.51 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  36.24 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  36.88 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  43.14 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  42.8 
 
 		 516 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  41.96 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  39.53 
 
 		 514 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  35.87 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  39.53 
 
 		 514 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  39.53 
 
 		 514 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  36.9 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  39.64 
 
 		 268 aa  155  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  39.22 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  45.63 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  38.93 
 
 		 517 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  38.34 
 
 		 514 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  39.13 
 
 		 514 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  43.12 
 
 		 500 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  34.62 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  40.89 
 
 		 492 aa  142  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  38.93 
 
 		 517 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  37.91 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  35.5 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  29.93 
 
 		 301 aa  122  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  34.91 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  33.62 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  34.07 
 
 		 261 aa  118  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  38.86 
 
 		 272 aa  109  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  36.1 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  34.62 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  28.95 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  26.63 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  31.58 
 
 		 752 aa  59.7  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  31.58 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  30.07 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  28.15 
 
 		 974 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  26.04 
 
 		 490 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  25.13 
 
 		 322 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  27.1 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  27.92 
 
 		 231 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  30.67 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  27.84 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  27.97 
 
 		 705 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  27.97 
 
 		 705 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  28.38 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  32.74 
 
 		 759 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  23.93 
 
 		 267 aa  49.3  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  32.2 
 
 		 760 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  26.9 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  26.9 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  26.9 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  25.26 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  29.71 
 
 		 502 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  29.66 
 
 		 759 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  24.74 
 
 		 551 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  26.39 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  22.75 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  26.71 
 
 		 277 aa  45.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  26.13 
 
 		 533 aa  45.4  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  29.66 
 
 		 759 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04663  spermine/spermidine synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08500)  29.29 
 
 		 558 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725678  normal  0.343569 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  28.03 
 
 		 510 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  25.73 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  32.65 
 
 		 759 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02960  hypothetical protein  26.55 
 
 		 837 aa  43.9  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  25.45 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  28.11 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  28.66 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  27.46 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  25.39 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  23.78 
 
 		 544 aa  42.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  27.78 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  28.03 
 
 		 251 aa  42.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  24.65 
 
 		 255 aa  42  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>