96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5354 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  88.91 
 
 		 514 aa  899    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1003    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  97.67 
 
 		 514 aa  979    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  92.41 
 
 		 514 aa  937    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  92.61 
 
 		 514 aa  939    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  52.24 
 
 		 516 aa  440  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  47.2 
 
 		 517 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  46.88 
 
 		 517 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  44.89 
 
 		 492 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  42.74 
 
 		 500 aa  319  7e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  30.18 
 
 		 490 aa  166  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  39.37 
 
 		 287 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  41.22 
 
 		 285 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  40.46 
 
 		 285 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  40.79 
 
 		 284 aa  159  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  39.61 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  41.24 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  39.53 
 
 		 273 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  38.1 
 
 		 281 aa  143  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  38.02 
 
 		 287 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  28.63 
 
 		 551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  26.12 
 
 		 558 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  35.14 
 
 		 307 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  29.5 
 
 		 541 aa  136  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  32.98 
 
 		 282 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  35.66 
 
 		 276 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  33.41 
 
 		 607 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  36.9 
 
 		 262 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  34.6 
 
 		 289 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  36.65 
 
 		 273 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  27.53 
 
 		 517 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  34.38 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  29.95 
 
 		 524 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  25.77 
 
 		 516 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  32.2 
 
 		 310 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  34.01 
 
 		 271 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  29.55 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  30.74 
 
 		 316 aa  113  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  32.61 
 
 		 261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 304 aa  111  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  35.94 
 
 		 268 aa  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  29.3 
 
 		 548 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  31.58 
 
 		 304 aa  103  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  40.49 
 
 		 266 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  27.17 
 
 		 502 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  28.68 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  34.13 
 
 		 280 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  26.43 
 
 		 544 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  23.97 
 
 		 533 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  25 
 
 		 974 aa  95.1  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  32.89 
 
 		 272 aa  94.7  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  26.16 
 
 		 551 aa  94.7  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  32.03 
 
 		 315 aa  94  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  30.26 
 
 		 262 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  33.33 
 
 		 320 aa  89.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  31.78 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  29.67 
 
 		 261 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  25.09 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  33.52 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  31.86 
 
 		 270 aa  76.6  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  28.42 
 
 		 203 aa  73.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  26.04 
 
 		 311 aa  72  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  27.92 
 
 		 339 aa  69.7  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  31.4 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  29.69 
 
 		 248 aa  66.6  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  30.2 
 
 		 248 aa  62.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  24.76 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  29.07 
 
 		 251 aa  59.7  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  26.92 
 
 		 705 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  26.18 
 
 		 705 aa  58.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  24.54 
 
 		 220 aa  57  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  26.15 
 
 		 334 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  31.21 
 
 		 876 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  26.44 
 
 		 475 aa  54.7  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  35.11 
 
 		 678 aa  53.5  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  33.57 
 
 		 1078 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  33.57 
 
 		 1078 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  32.2 
 
 		 752 aa  50.4  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  29.27 
 
 		 759 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1079 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  29.17 
 
 		 307 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  28.65 
 
 		 991 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  23.3 
 
 		 819 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  27.1 
 
 		 759 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7525  hypothetical protein  26.9 
 
 		 205 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  24.35 
 
 		 1017 aa  47  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  29.65 
 
 		 982 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  30.18 
 
 		 844 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  25.84 
 
 		 276 aa  45.8  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  23.77 
 
 		 835 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2698  putative transporter  35.42 
 
 		 744 aa  45.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  28.42 
 
 		 674 aa  43.5  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  24.28 
 
 		 803 aa  43.9  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  31 
 
 		 735 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  28.97 
 
 		 231 aa  43.5  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  32.23 
 
 		 283 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>