92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0442 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  996    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  92.83 
 
 
517 aa  899    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  56.39 
 
 
516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  48.79 
 
 
514 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  48.88 
 
 
514 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  48.79 
 
 
514 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  47.56 
 
 
514 aa  412  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  47.37 
 
 
514 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  50 
 
 
500 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  48.38 
 
 
492 aa  366  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  43.56 
 
 
285 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  42.21 
 
 
287 aa  173  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  42.05 
 
 
285 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  47.71 
 
 
284 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  29.42 
 
 
490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  39.6 
 
 
296 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  38.93 
 
 
273 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  39.52 
 
 
287 aa  147  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  41.39 
 
 
276 aa  146  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  34.34 
 
 
607 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  38.14 
 
 
289 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  36.51 
 
 
307 aa  140  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  37.76 
 
 
287 aa  140  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  34.93 
 
 
316 aa  136  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  41.67 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  38.57 
 
 
310 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  26.65 
 
 
558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  29.84 
 
 
510 aa  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  36.14 
 
 
273 aa  133  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  34.72 
 
 
282 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  38.05 
 
 
261 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  28.71 
 
 
551 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  35.09 
 
 
304 aa  120  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  23.48 
 
 
533 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  36.55 
 
 
332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  35.71 
 
 
280 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 
304 aa  118  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  30.28 
 
 
524 aa  118  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  32.92 
 
 
268 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  26.33 
 
 
516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  36.13 
 
 
271 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  30.81 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  34.23 
 
 
261 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  33.05 
 
 
262 aa  111  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  30.25 
 
 
301 aa  109  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  27.76 
 
 
517 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  37.02 
 
 
320 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  35.82 
 
 
315 aa  107  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  38.38 
 
 
270 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  34.51 
 
 
262 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  27.8 
 
 
551 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  35.39 
 
 
272 aa  95.5  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  29.14 
 
 
551 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  33.65 
 
 
309 aa  95.5  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  26.78 
 
 
544 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  26.49 
 
 
541 aa  94.4  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  32.65 
 
 
974 aa  94.7  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  35.68 
 
 
266 aa  94.4  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  28.61 
 
 
548 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  36.31 
 
 
286 aa  86.3  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  35.67 
 
 
203 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  31.46 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  28.23 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  31.31 
 
 
307 aa  67  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  29.45 
 
 
220 aa  65.1  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  29.45 
 
 
759 aa  60.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  33.33 
 
 
760 aa  60.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  23.72 
 
 
311 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  32.17 
 
 
759 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  32.99 
 
 
759 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  28.57 
 
 
322 aa  53.5  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  29.53 
 
 
752 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  22.17 
 
 
308 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  30.41 
 
 
248 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  26.54 
 
 
339 aa  52  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  30.77 
 
 
759 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  23.66 
 
 
471 aa  50.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  25.21 
 
 
819 aa  47  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  24.27 
 
 
803 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  24.65 
 
 
276 aa  46.2  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  30.57 
 
 
681 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3029  hypothetical protein  27.63 
 
 
188 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  30.7 
 
 
678 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  27.36 
 
 
231 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  38.27 
 
 
830 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  28.7 
 
 
334 aa  44.3  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  32.79 
 
 
1078 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  24.74 
 
 
278 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  21.84 
 
 
749 aa  43.9  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  27.84 
 
 
991 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  27.74 
 
 
284 aa  43.5  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  40.54 
 
 
876 aa  43.5  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>