122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2255 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  947    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  50.51 
 
 		 516 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  48.99 
 
 		 517 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  47.18 
 
 		 517 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  48.74 
 
 		 500 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  44.96 
 
 		 514 aa  353  4e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  44.96 
 
 		 514 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  46.28 
 
 		 514 aa  351  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  45.09 
 
 		 514 aa  351  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  44.89 
 
 		 514 aa  350  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  42.98 
 
 		 287 aa  170  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  39.36 
 
 		 296 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  41.09 
 
 		 285 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  39.53 
 
 		 285 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  42.4 
 
 		 287 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  41.5 
 
 		 284 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  41.22 
 
 		 276 aa  149  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  36.15 
 
 		 287 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  38.36 
 
 		 307 aa  146  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  40.89 
 
 		 281 aa  144  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  29.4 
 
 		 490 aa  143  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  37.86 
 
 		 273 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  27.45 
 
 		 558 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  36.71 
 
 		 268 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  37.45 
 
 		 289 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  37.31 
 
 		 271 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  36.51 
 
 		 273 aa  128  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  34.62 
 
 		 607 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  34.84 
 
 		 310 aa  127  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  39.27 
 
 		 262 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  27.03 
 
 		 516 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  31.29 
 
 		 316 aa  123  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  29.52 
 
 		 551 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  29.08 
 
 		 517 aa  117  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  27.93 
 
 		 551 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  34.91 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  30.72 
 
 		 510 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  34.72 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  27.88 
 
 		 541 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  38.05 
 
 		 272 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  33.01 
 
 		 261 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  35.27 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  30.98 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  35.51 
 
 		 304 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  32.31 
 
 		 262 aa  108  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  31.67 
 
 		 261 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  22.96 
 
 		 533 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  31.22 
 
 		 551 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  37.14 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  28.52 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  35.29 
 
 		 270 aa  101  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  33.19 
 
 		 315 aa  100  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  33.96 
 
 		 280 aa  100  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  41.91 
 
 		 974 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  31.36 
 
 		 548 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  27.45 
 
 		 544 aa  97.1  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  39.87 
 
 		 266 aa  89  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  31.82 
 
 		 301 aa  89  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  29.31 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  33.14 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  26.36 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  28.74 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  29.57 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  28.29 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  42.11 
 
 		 678 aa  70.5  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  26.24 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  32.32 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  32.6 
 
 		 681 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  33.01 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  29.33 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  28.61 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  24.76 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  33.88 
 
 		 735 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  24.73 
 
 		 220 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  31.96 
 
 		 752 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  33.07 
 
 		 674 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  29.95 
 
 		 257 aa  54.7  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  35.58 
 
 		 876 aa  54.3  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  27.39 
 
 		 247 aa  53.9  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  28.03 
 
 		 247 aa  53.9  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  31.67 
 
 		 760 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  28.03 
 
 		 247 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  28.03 
 
 		 247 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  29.85 
 
 		 255 aa  53.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  34.34 
 
 		 759 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  33.33 
 
 		 759 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2698  putative transporter  42.67 
 
 		 744 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  22.11 
 
 		 1017 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  25.44 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  28.03 
 
 		 247 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  28.79 
 
 		 334 aa  51.2  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  27.27 
 
 		 247 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  27.27 
 
 		 261 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  29.09 
 
 		 782 aa  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  27.27 
 
 		 261 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  29.66 
 
 		 705 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  29.66 
 
 		 705 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  27.27 
 
 		 247 aa  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  25.93 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  28.22 
 
 		 278 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>