201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06540 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  36.73 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  39.13 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  33.48 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  33.99 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  32.31 
 
 		 490 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  28.15 
 
 		 558 aa  85.5  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  33.33 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  29.07 
 
 		 524 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  30.11 
 
 		 541 aa  82  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  30.41 
 
 		 607 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  30.21 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  35.95 
 
 		 231 aa  72  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  32.2 
 
 		 516 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  30.08 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  38.06 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  28.89 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  33.01 
 
 		 492 aa  65.5  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  33.95 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  29.93 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  31.82 
 
 		 514 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  32.74 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  29.5 
 
 		 500 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  32.74 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  32.74 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  30.2 
 
 		 514 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  31.69 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  27.47 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  29.82 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  32.32 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  32.76 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  26.67 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  28.14 
 
 		 514 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  24.48 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  33.83 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  28.14 
 
 		 514 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  32.74 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  33.83 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  29.7 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  28.16 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  28.65 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  34.93 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  24.73 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  32.28 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  28.38 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  31.87 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  27.17 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  25.38 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  26.11 
 
 		 551 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  36.49 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  31.25 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  25.87 
 
 		 517 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  30.66 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  30.66 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  30.43 
 
 		 301 aa  52.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  31.71 
 
 		 551 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  30.77 
 
 		 281 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  31.79 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0159  hypothetical protein  27.65 
 
 		 254 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0669306  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  30.41 
 
 		 517 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  30.85 
 
 		 282 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04883  putative integral membrane protein  31.78 
 
 		 494 aa  52  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  27.23 
 
 		 261 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  30.88 
 
 		 287 aa  52  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  29.41 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  30.26 
 
 		 548 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  28.4 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  27.27 
 
 		 310 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  29.3 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  28.65 
 
 		 517 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  26.47 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1738  Spermidine synthase-like protein  26.69 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  34.15 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  31.13 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  28.24 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  31.58 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  31.1 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  29.56 
 
 		 280 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  26.67 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  26.9 
 
 		 387 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  26.9 
 
 		 398 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  27.95 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  26.42 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0335  spermidine synthase  32.82 
 
 		 278 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  26.25 
 
 		 307 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  26.88 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  32.48 
 
 		 286 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  27.87 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  26.9 
 
 		 387 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  27.49 
 
 		 289 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  32.48 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0156  spermidine synthase  32.82 
 
 		 316 aa  48.9  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  25.27 
 
 		 316 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  26.47 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  31.13 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  26.9 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  26.9 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  26.13 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  26.9 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  26.9 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>