31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0159 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0159  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  500  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0669306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1916  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 291 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  32.46 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  23.26 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  29.76 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  31.22 
 
 		 548 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  29.25 
 
 		 516 aa  55.8  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  29.9 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  27.65 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  31.54 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  23.08 
 
 		 558 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  31.54 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  32.52 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  32.52 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  31.71 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  32.73 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  30.72 
 
 		 490 aa  48.5  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  30.08 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  30.08 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  30.08 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2865  hypothetical protein  34.56 
 
 		 819 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0368958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  32 
 
 		 304 aa  46.2  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  35.25 
 
 		 538 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  36.71 
 
 		 248 aa  45.4  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  34.38 
 
 		 522 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4279  hypothetical protein  33.33 
 
 		 818 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  27.27 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  29.27 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  33.03 
 
 		 678 aa  43.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  21.11 
 
 		 533 aa  42.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  28.23 
 
 		 334 aa  42.4  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>