35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2865 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0150  spermidine synthase-like  48.08 
 
 		 812 aa  721    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4279  hypothetical protein  51.73 
 
 		 818 aa  726    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2865  hypothetical protein  100 
 
 		 819 aa  1632    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0368958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3330  hypothetical protein  37.33 
 
 		 783 aa  438  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0454731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0453  hypothetical protein  31.7 
 
 		 828 aa  344  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4224  hypothetical protein  32.9 
 
 		 821 aa  339  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.965892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0793  hypothetical protein  31.65 
 
 		 827 aa  337  5e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.526313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2180  hypothetical protein  30.22 
 
 		 889 aa  283  9e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.786018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2791  hypothetical protein  28.62 
 
 		 806 aa  272  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2931  hypothetical protein  30.19 
 
 		 766 aa  162  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0187375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3413  Spermidine synthase-like protein  35.59 
 
 		 681 aa  80.9  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.730337  normal  0.555353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5063  Spermidine synthase-like protein  32.91 
 
 		 692 aa  76.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2591  hypothetical protein  39.13 
 
 		 106 aa  57.8  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000151493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  28.45 
 
 		 284 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  31.2 
 
 		 320 aa  54.3  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  31.2 
 
 		 320 aa  53.9  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  31.34 
 
 		 982 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  31.34 
 
 		 983 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  27.23 
 
 		 1017 aa  52  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  29.13 
 
 		 837 aa  51.2  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  33.06 
 
 		 326 aa  49.7  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2430  Spermine synthase  30.65 
 
 		 529 aa  48.1  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514854  hitchhiker  0.00202916 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  30.11 
 
 		 541 aa  48.1  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  25.36 
 
 		 283 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24640  spermidine synthase  32.23 
 
 		 283 aa  47.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.845245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  29.19 
 
 		 490 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0159  hypothetical protein  34.56 
 
 		 254 aa  46.6  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0669306  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  31.25 
 
 		 328 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  29.03 
 
 		 248 aa  46.6  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  32.14 
 
 		 1078 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  32.14 
 
 		 1078 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  32.86 
 
 		 1079 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  28.8 
 
 		 283 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  26.88 
 
 		 248 aa  44.3  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  27.15 
 
 		 311 aa  44.3  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>