21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2180 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2180  hypothetical protein  100 
 
 		 889 aa  1774    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.786018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2865  hypothetical protein  30.22 
 
 		 819 aa  272  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0368958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3330  hypothetical protein  26.92 
 
 		 783 aa  263  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0454731  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0150  spermidine synthase-like  29.87 
 
 		 812 aa  192  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4279  hypothetical protein  31.19 
 
 		 818 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2791  hypothetical protein  25.52 
 
 		 806 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0793  hypothetical protein  25.81 
 
 		 827 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.526313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4224  hypothetical protein  23.19 
 
 		 821 aa  111  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.965892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0453  hypothetical protein  31.54 
 
 		 828 aa  108  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2931  hypothetical protein  30.43 
 
 		 766 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0187375  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  30.37 
 
 		 1017 aa  48.5  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5063  Spermidine synthase-like protein  24.24 
 
 		 692 aa  48.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  27.23 
 
 		 1078 aa  47.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  27.21 
 
 		 982 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  27.23 
 
 		 1078 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3413  Spermidine synthase-like protein  26.52 
 
 		 681 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.730337  normal  0.555353 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1079 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  28.1 
 
 		 320 aa  45.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  29.32 
 
 		 302 aa  45.1  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  28.1 
 
 		 320 aa  44.7  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2591  hypothetical protein  42.42 
 
 		 106 aa  44.3  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000151493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>