259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2502 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  100 
 
 		 1017 aa  2029    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  45.14 
 
 		 983 aa  704    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  45.78 
 
 		 982 aa  685    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  44.59 
 
 		 991 aa  723    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  32.69 
 
 		 876 aa  312  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  34.32 
 
 		 1078 aa  307  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  34.54 
 
 		 1078 aa  307  6e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  35.54 
 
 		 1079 aa  303  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  31.9 
 
 		 836 aa  295  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  31.05 
 
 		 844 aa  285  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  29.29 
 
 		 749 aa  284  6.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  31.84 
 
 		 842 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  31.43 
 
 		 830 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  31.19 
 
 		 835 aa  232  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  27.64 
 
 		 782 aa  220  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  30.15 
 
 		 837 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  27.89 
 
 		 819 aa  212  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  28.03 
 
 		 875 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  27.04 
 
 		 803 aa  205  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  29.48 
 
 		 903 aa  203  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  28.35 
 
 		 1040 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  28.38 
 
 		 758 aa  170  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  26.48 
 
 		 765 aa  122  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  26.47 
 
 		 759 aa  108  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  26.44 
 
 		 541 aa  100  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2651  putative spermidine synthase  25.15 
 
 		 765 aa  96.3  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  27.56 
 
 		 533 aa  90.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  25.46 
 
 		 503 aa  88.2  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  26.03 
 
 		 528 aa  85.5  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  27.04 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  32.52 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  28.65 
 
 		 299 aa  84.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  28.99 
 
 		 519 aa  83.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  32.21 
 
 		 304 aa  83.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  29.07 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  24.63 
 
 		 536 aa  82  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1613  spermine synthase  34.04 
 
 		 753 aa  81.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0627097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  31.43 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  29.79 
 
 		 275 aa  80.9  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  32.33 
 
 		 296 aa  80.5  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  29.61 
 
 		 328 aa  80.9  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  30.99 
 
 		 296 aa  79.7  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  30.99 
 
 		 296 aa  79.7  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  24.67 
 
 		 499 aa  79.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  31.91 
 
 		 286 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  30.99 
 
 		 304 aa  79.7  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  31.58 
 
 		 293 aa  79.3  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  30.99 
 
 		 296 aa  79.7  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  24.31 
 
 		 503 aa  79  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  26.1 
 
 		 521 aa  79.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  29.75 
 
 		 286 aa  79.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  30.5 
 
 		 291 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  25.47 
 
 		 301 aa  77  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  30.33 
 
 		 302 aa  76.6  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  28.87 
 
 		 285 aa  77  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  28.37 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  30.5 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  28.37 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  26.67 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  29.79 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  29.79 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  24.65 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  26.32 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  24.5 
 
 		 521 aa  74.7  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  28.57 
 
 		 288 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  28.57 
 
 		 288 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  33.12 
 
 		 748 aa  74.3  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  28.57 
 
 		 288 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  28.57 
 
 		 288 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  28.57 
 
 		 288 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  26.32 
 
 		 504 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  28.57 
 
 		 288 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  26.32 
 
 		 504 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  26.32 
 
 		 504 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  28.57 
 
 		 288 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  28.57 
 
 		 288 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  26.32 
 
 		 504 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  30.5 
 
 		 287 aa  73.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  29.29 
 
 		 289 aa  73.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  26.67 
 
 		 538 aa  73.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  22.39 
 
 		 498 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  30.41 
 
 		 349 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  31.47 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  26.43 
 
 		 277 aa  73.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  25.82 
 
 		 504 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  29.07 
 
 		 280 aa  72.8  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  23.2 
 
 		 551 aa  72.8  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  31.03 
 
 		 310 aa  72.8  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  28.49 
 
 		 280 aa  72.8  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  25.29 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  26.59 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  27.46 
 
 		 288 aa  72  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  28.49 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4071  Spermine synthase  30.21 
 
 		 1244 aa  71.6  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0773201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  26.69 
 
 		 515 aa  71.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  28.57 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  28.57 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  27.86 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  25.41 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  28.57 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>