180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2119 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  100 
 
 		 903 aa  1725    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  44.15 
 
 		 875 aa  592  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  33.75 
 
 		 844 aa  253  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  33.12 
 
 		 876 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  29.53 
 
 		 1017 aa  233  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  28.91 
 
 		 991 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  29.73 
 
 		 983 aa  231  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  29.55 
 
 		 982 aa  219  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  28.26 
 
 		 835 aa  216  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  31.8 
 
 		 842 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  33.29 
 
 		 1078 aa  214  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  33 
 
 		 1078 aa  212  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1079 aa  197  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  27.16 
 
 		 749 aa  194  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  28.64 
 
 		 836 aa  193  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  33.41 
 
 		 830 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  28.15 
 
 		 782 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  28.12 
 
 		 1040 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  27.4 
 
 		 803 aa  145  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  27.46 
 
 		 837 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  26.74 
 
 		 758 aa  139  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  27.59 
 
 		 536 aa  80.9  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  30.38 
 
 		 819 aa  78.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  24.5 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  27.66 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  27.27 
 
 		 765 aa  70.5  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  30 
 
 		 757 aa  70.5  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  26.94 
 
 		 502 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  22.01 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  35 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  27.27 
 
 		 293 aa  67.4  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  25.44 
 
 		 498 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  27.27 
 
 		 296 aa  67  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  36.43 
 
 		 304 aa  62.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  31.4 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  33.05 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  30.89 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  31.85 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  23.34 
 
 		 541 aa  60.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  27.94 
 
 		 288 aa  59.7  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  26.42 
 
 		 302 aa  59.7  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  26.51 
 
 		 504 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  26.27 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  26.27 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04883  putative integral membrane protein  26.33 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  26.27 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  27.55 
 
 		 520 aa  59.3  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  26.27 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  24.75 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  26.91 
 
 		 759 aa  58.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  31.11 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  27.63 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  31.36 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  25.82 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  26.49 
 
 		 748 aa  57.8  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  25.54 
 
 		 504 aa  57  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  29.49 
 
 		 277 aa  57.4  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  25.81 
 
 		 295 aa  57.4  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  24.51 
 
 		 551 aa  56.6  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  31.82 
 
 		 305 aa  56.2  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  27.81 
 
 		 292 aa  56.2  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  26.97 
 
 		 529 aa  56.2  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  30.63 
 
 		 291 aa  55.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  27.53 
 
 		 279 aa  56.2  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  32.59 
 
 		 286 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  25.99 
 
 		 567 aa  55.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  24.14 
 
 		 503 aa  55.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0156  spermidine synthase  33.88 
 
 		 316 aa  55.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0335  spermidine synthase  33.88 
 
 		 278 aa  55.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  24.24 
 
 		 517 aa  55.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  33.09 
 
 		 521 aa  54.7  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0150  spermidine synthase-like  36.92 
 
 		 812 aa  54.7  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  36.22 
 
 		 289 aa  55.1  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5377  spermidine synthase  31.65 
 
 		 375 aa  54.7  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  32.79 
 
 		 286 aa  54.7  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  30.58 
 
 		 285 aa  54.3  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  22.22 
 
 		 277 aa  53.9  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  25.06 
 
 		 490 aa  54.3  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  25.74 
 
 		 528 aa  53.9  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3461  spermidine synthase  30.13 
 
 		 278 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  27.89 
 
 		 349 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  22.19 
 
 		 533 aa  53.5  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  28.69 
 
 		 375 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  26.28 
 
 		 533 aa  53.5  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  32.81 
 
 		 312 aa  52.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  31.75 
 
 		 292 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  33.76 
 
 		 287 aa  52.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  32.77 
 
 		 243 aa  52.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  28.39 
 
 		 275 aa  52.4  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  32.79 
 
 		 286 aa  52.4  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  30.19 
 
 		 363 aa  52  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  28.93 
 
 		 290 aa  52  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  24.76 
 
 		 521 aa  52  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  28.57 
 
 		 313 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2430  Spermine synthase  29.47 
 
 		 529 aa  51.6  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514854  hitchhiker  0.00202916 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  23.8 
 
 		 503 aa  51.2  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  30.13 
 
 		 275 aa  51.2  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5500  spermidine synthase  31.45 
 
 		 275 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5067  spermidine synthase  31.45 
 
 		 275 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.694497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5619  spermidine synthase  31.45 
 
 		 275 aa  50.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>