81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2535 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1613  spermine synthase  58.01 
 
 		 753 aa  697    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0627097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2651  putative spermidine synthase  62.2 
 
 		 765 aa  776    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  80.65 
 
 		 759 aa  1141    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  100 
 
 		 765 aa  1518    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04883  putative integral membrane protein  33.26 
 
 		 494 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  28.51 
 
 		 803 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  28.14 
 
 		 876 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  26.67 
 
 		 1017 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  30.9 
 
 		 1078 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  26.69 
 
 		 982 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  30.75 
 
 		 1078 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  36.27 
 
 		 819 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  26.31 
 
 		 983 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  26.07 
 
 		 782 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1079 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  26.97 
 
 		 758 aa  124  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  27.85 
 
 		 837 aa  117  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  27.54 
 
 		 830 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  26.3 
 
 		 842 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  28.18 
 
 		 991 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  25.44 
 
 		 835 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  27.03 
 
 		 844 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  24.83 
 
 		 836 aa  94.7  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  30.69 
 
 		 1040 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  24.89 
 
 		 749 aa  85.1  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  26.67 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  27.8 
 
 		 875 aa  69.7  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  23.39 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  26.43 
 
 		 521 aa  68.6  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  31.9 
 
 		 220 aa  62.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  23.91 
 
 		 558 aa  62.4  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  23.21 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  22.83 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04884  spermine/spermidine synthase family protein  44 
 
 		 92 aa  57  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.934898  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  26.51 
 
 		 528 aa  55.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  25.51 
 
 		 520 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  26.12 
 
 		 516 aa  53.9  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  32.64 
 
 		 903 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  26.06 
 
 		 514 aa  52.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0905  Spermine synthase  27.71 
 
 		 805 aa  52  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0140843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  26.34 
 
 		 517 aa  52.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  30.43 
 
 		 522 aa  52  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  22.73 
 
 		 498 aa  51.6  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  29.06 
 
 		 295 aa  51.6  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  23.58 
 
 		 528 aa  51.6  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  26.95 
 
 		 284 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  25.81 
 
 		 514 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  29.28 
 
 		 517 aa  50.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  25.81 
 
 		 514 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  26.89 
 
 		 521 aa  50.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  31.03 
 
 		 248 aa  49.7  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  25.17 
 
 		 757 aa  50.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  26.34 
 
 		 974 aa  50.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  25.9 
 
 		 520 aa  49.7  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  27.96 
 
 		 471 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  25.48 
 
 		 514 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  26.11 
 
 		 283 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  25.6 
 
 		 514 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  26.15 
 
 		 519 aa  48.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  25.48 
 
 		 514 aa  47.8  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  24.75 
 
 		 515 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  23.65 
 
 		 533 aa  47  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  25.93 
 
 		 273 aa  47  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  28.38 
 
 		 235 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  28.38 
 
 		 235 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  24.93 
 
 		 520 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  24.93 
 
 		 520 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  27.34 
 
 		 287 aa  47  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  27.69 
 
 		 525 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  27.78 
 
 		 536 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  27.69 
 
 		 525 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  24.24 
 
 		 527 aa  46.2  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  30.25 
 
 		 286 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  30.25 
 
 		 286 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  29.06 
 
 		 289 aa  45.8  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  24.83 
 
 		 305 aa  45.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  24.26 
 
 		 304 aa  45.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  23.97 
 
 		 551 aa  44.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  29.23 
 
 		 523 aa  44.3  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  27.83 
 
 		 334 aa  44.3  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  22.6 
 
 		 521 aa  44.3  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>