194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2131 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  64.88 
 
 		 876 aa  988    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  100 
 
 		 830 aa  1610    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  64.33 
 
 		 844 aa  961    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  63.22 
 
 		 842 aa  921    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  32.16 
 
 		 1017 aa  287  7e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  31.85 
 
 		 983 aa  284  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  35.12 
 
 		 1078 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  34.99 
 
 		 1078 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  31.46 
 
 		 835 aa  278  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  32.45 
 
 		 991 aa  276  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  34.99 
 
 		 1079 aa  270  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  31.51 
 
 		 836 aa  269  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  31.63 
 
 		 982 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  33.73 
 
 		 875 aa  253  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  27.99 
 
 		 749 aa  233  9e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  29.65 
 
 		 782 aa  228  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  27.96 
 
 		 803 aa  211  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  33.94 
 
 		 903 aa  196  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  26.87 
 
 		 837 aa  195  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  27.72 
 
 		 819 aa  195  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  28.1 
 
 		 758 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  27.72 
 
 		 765 aa  120  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  27.99 
 
 		 759 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  31.97 
 
 		 1040 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2651  putative spermidine synthase  27.55 
 
 		 765 aa  106  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  26.45 
 
 		 504 aa  92  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  26.5 
 
 		 504 aa  89.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  26.5 
 
 		 504 aa  89.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  26.5 
 
 		 504 aa  89.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  26.45 
 
 		 504 aa  87.8  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  25.83 
 
 		 516 aa  87.4  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  26.45 
 
 		 504 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  25.22 
 
 		 498 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  23.63 
 
 		 508 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  24.4 
 
 		 551 aa  77.4  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  26.29 
 
 		 499 aa  76.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1613  spermine synthase  35.93 
 
 		 753 aa  74.7  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0627097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  27.86 
 
 		 517 aa  74.3  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  24.6 
 
 		 525 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  24.6 
 
 		 525 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  24.7 
 
 		 503 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  24.61 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  26.11 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  25.88 
 
 		 536 aa  71.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  30.3 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  24.57 
 
 		 277 aa  70.5  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  24.63 
 
 		 490 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  24.39 
 
 		 525 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  24.37 
 
 		 527 aa  69.3  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  29.65 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  25.35 
 
 		 528 aa  68.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  25 
 
 		 521 aa  68.6  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  24.65 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  22.73 
 
 		 558 aa  67  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  24.91 
 
 		 548 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  25.15 
 
 		 533 aa  65.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  24.62 
 
 		 551 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  26.62 
 
 		 521 aa  64.7  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  24.5 
 
 		 510 aa  63.9  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  37.41 
 
 		 285 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  27.15 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  23.93 
 
 		 515 aa  62  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  24.03 
 
 		 544 aa  62  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  23.35 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1816  spermidine synthase  26.46 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.150426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  22.42 
 
 		 514 aa  60.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  23.88 
 
 		 529 aa  60.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  28.57 
 
 		 307 aa  60.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  27.4 
 
 		 304 aa  59.7  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  29.88 
 
 		 320 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  29.88 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  26.12 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2470  spermidine synthase  38.02 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3468  spermidine synthase  38.02 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0390  spermidine synthase  38.02 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1250  spermidine synthase  38.02 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3433  spermidine synthase  38.02 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3470  spermidine synthase  38.02 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3315  spermidine synthase  38.02 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  26.49 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  30.98 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  28.12 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04883  putative integral membrane protein  29.27 
 
 		 494 aa  57.4  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  23.73 
 
 		 551 aa  57.4  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  25.76 
 
 		 293 aa  56.2  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  26.85 
 
 		 523 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  26.38 
 
 		 277 aa  55.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  27.01 
 
 		 510 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  26.88 
 
 		 287 aa  55.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  25.76 
 
 		 296 aa  55.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  26.54 
 
 		 283 aa  55.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  29.55 
 
 		 279 aa  55.1  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  27.67 
 
 		 290 aa  54.7  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  31.55 
 
 		 283 aa  54.3  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  30.63 
 
 		 607 aa  54.3  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3461  spermidine synthase  26.4 
 
 		 278 aa  54.3  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  28.09 
 
 		 519 aa  54.3  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  27.16 
 
 		 275 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  27.82 
 
 		 279 aa  53.9  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  29.35 
 
 		 375 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>