99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1613 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1613  spermine synthase  100 
 
 
753 aa  1461    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0627097  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2651  putative spermidine synthase  59.84 
 
 
765 aa  711    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  58.95 
 
 
759 aa  762    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  58.59 
 
 
765 aa  762    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04883  putative integral membrane protein  34.56 
 
 
494 aa  221  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  30.06 
 
 
803 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  32.77 
 
 
1078 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  32.35 
 
 
1078 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  33.75 
 
 
1079 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  29.08 
 
 
983 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  26.94 
 
 
1017 aa  153  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  29.48 
 
 
982 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  30.8 
 
 
876 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  28.42 
 
 
782 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  27.97 
 
 
835 aa  139  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  31.15 
 
 
991 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  27.73 
 
 
837 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  27.14 
 
 
836 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  30.85 
 
 
842 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  37.5 
 
 
819 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  26.8 
 
 
758 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  27.27 
 
 
844 aa  112  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  26.93 
 
 
749 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  28.78 
 
 
830 aa  104  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  33.7 
 
 
1040 aa  88.2  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  27.45 
 
 
875 aa  77.8  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  34.65 
 
 
757 aa  67.8  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  31.33 
 
 
522 aa  63.9  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  33.33 
 
 
299 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  33.75 
 
 
903 aa  62.4  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  26.42 
 
 
558 aa  61.2  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  26.85 
 
 
520 aa  60.1  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  31.25 
 
 
220 aa  58.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  24.17 
 
 
536 aa  57.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  26.36 
 
 
515 aa  57.4  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  29.75 
 
 
523 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  26.46 
 
 
521 aa  56.6  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  31.78 
 
 
508 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  30.65 
 
 
283 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  26 
 
 
498 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  24.83 
 
 
502 aa  53.9  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  27.61 
 
 
284 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  28.07 
 
 
276 aa  53.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  29.37 
 
 
521 aa  53.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  27.6 
 
 
520 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  29.41 
 
 
312 aa  52.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  29.37 
 
 
514 aa  52.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  30.5 
 
 
533 aa  52.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  29.66 
 
 
286 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  29.66 
 
 
286 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  28.81 
 
 
289 aa  52  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  29.66 
 
 
286 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  28.32 
 
 
520 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  28.32 
 
 
520 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  29.66 
 
 
286 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  29.66 
 
 
286 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04884  spermine/spermidine synthase family protein  42.67 
 
 
92 aa  51.2  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.934898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  23.39 
 
 
533 aa  51.2  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  29.66 
 
 
288 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  29.66 
 
 
288 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  29.66 
 
 
288 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  29.66 
 
 
288 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  29.66 
 
 
288 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  29.66 
 
 
288 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  29.66 
 
 
288 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  29.66 
 
 
288 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  27.73 
 
 
292 aa  50.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  27.73 
 
 
279 aa  48.5  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  29.06 
 
 
286 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  28.07 
 
 
283 aa  48.5  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  28.93 
 
 
277 aa  48.5  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  24.64 
 
 
295 aa  48.1  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  29.06 
 
 
286 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  26.98 
 
 
519 aa  48.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  31.62 
 
 
248 aa  47.8  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  28.33 
 
 
289 aa  47.8  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  28.81 
 
 
288 aa  47.8  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  25.64 
 
 
305 aa  47  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  26.89 
 
 
277 aa  47  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  27.03 
 
 
334 aa  47.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  26.51 
 
 
528 aa  47  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40259  predicted protein  30.34 
 
 
316 aa  46.6  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0644688  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  23.7 
 
 
528 aa  46.6  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  34.15 
 
 
234 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  24.94 
 
 
490 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  27.91 
 
 
289 aa  46.6  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  24.84 
 
 
521 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  26.79 
 
 
548 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  32.45 
 
 
517 aa  45.8  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  31.79 
 
 
517 aa  45.8  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  26.24 
 
 
275 aa  46.2  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  31.71 
 
 
234 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  24.5 
 
 
510 aa  45.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  24.39 
 
 
538 aa  45.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0443  Spermine synthase  25.84 
 
 
293 aa  44.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  28.12 
 
 
273 aa  44.3  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  26.54 
 
 
551 aa  44.3  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  27.27 
 
 
291 aa  44.3  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  26.81 
 
 
280 aa  43.9  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.138188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>