297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1156 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  100 
 
 		 538 aa  1053    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  63.28 
 
 		 528 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  61.24 
 
 		 515 aa  589  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  64.94 
 
 		 519 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  61.08 
 
 		 521 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  61.79 
 
 		 533 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  50.6 
 
 		 522 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  50 
 
 		 520 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  49.8 
 
 		 520 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  49.8 
 
 		 520 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  40.23 
 
 		 508 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  45.69 
 
 		 521 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  44.83 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  46.81 
 
 		 523 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  45.26 
 
 		 528 aa  375  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  42.39 
 
 		 525 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  42.72 
 
 		 510 aa  363  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  41.18 
 
 		 536 aa  363  4e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  43.02 
 
 		 503 aa  362  8e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  40.66 
 
 		 498 aa  361  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  43.88 
 
 		 527 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  41.65 
 
 		 525 aa  359  6e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  41.65 
 
 		 525 aa  359  6e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  43.77 
 
 		 510 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  43.42 
 
 		 514 aa  356  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  43.77 
 
 		 521 aa  355  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  41.07 
 
 		 504 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  41.27 
 
 		 504 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  41.07 
 
 		 504 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  41.07 
 
 		 504 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  41.07 
 
 		 504 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  41.07 
 
 		 504 aa  347  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  41.54 
 
 		 503 aa  346  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  37.98 
 
 		 510 aa  324  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  42.21 
 
 		 520 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  38.73 
 
 		 567 aa  298  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  37.41 
 
 		 529 aa  280  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4189  spermidine synthase  31.5 
 
 		 568 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0906  spermidine synthase  32.25 
 
 		 570 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.975863  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3112  spermidine synthase  32.07 
 
 		 577 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0699  spermidine synthase  32.25 
 
 		 566 aa  230  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000065174  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0829  spermidine synthase  32.25 
 
 		 577 aa  229  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0924  spermidine synthase  32.14 
 
 		 574 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0860  spermidine synthase  32.07 
 
 		 577 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3448  spermidine synthase  31.96 
 
 		 574 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0724  spermidine synthase  32.53 
 
 		 576 aa  225  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105401  hitchhiker  0.00000291342 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3480  spermidine synthase  30.82 
 
 		 575 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.212317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0914  spermidine synthase  31.78 
 
 		 574 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.013206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0890  spermidine synthase  31.78 
 
 		 574 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.164164  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3836  spermidine synthase  30.81 
 
 		 595 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0396024  unclonable  0.000000000324026 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0625  spermidine synthase  31.77 
 
 		 575 aa  219  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.415321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3763  spermidine synthase  32.19 
 
 		 574 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2666  spermidine synthase  31.27 
 
 		 571 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00544767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3089  spermidine synthase  31.35 
 
 		 574 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3264  spermidine synthase  30.51 
 
 		 586 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.239403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5377  spermidine synthase  46.85 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  46.4 
 
 		 363 aa  183  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5060  spermidine synthase  46.4 
 
 		 360 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5445  spermidine synthase  46.4 
 
 		 360 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5301  spermidine synthase  46.4 
 
 		 360 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000883431 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4890  spermidine synthase  45.95 
 
 		 405 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4905  spermidine synthase  46.4 
 
 		 369 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5627  spermidine synthase  45.5 
 
 		 360 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000165937 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  40.09 
 
 		 305 aa  146  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  33.68 
 
 		 312 aa  136  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  37.71 
 
 		 291 aa  136  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  37.66 
 
 		 303 aa  135  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  35.54 
 
 		 314 aa  133  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  32.51 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  35.59 
 
 		 283 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  35.69 
 
 		 289 aa  130  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  38.43 
 
 		 291 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  31.8 
 
 		 308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  31.8 
 
 		 308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  31.68 
 
 		 304 aa  127  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  34.45 
 
 		 291 aa  126  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  33.73 
 
 		 313 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  36.14 
 
 		 292 aa  123  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  36.09 
 
 		 326 aa  123  9e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  36.88 
 
 		 287 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  33.19 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  30.83 
 
 		 304 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  30.42 
 
 		 283 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  35.23 
 
 		 283 aa  120  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  37.26 
 
 		 289 aa  120  9e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  29.39 
 
 		 283 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  33.88 
 
 		 328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  34.87 
 
 		 286 aa  117  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  29.58 
 
 		 283 aa  117  6e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0564  spermidine synthase  42.22 
 
 		 293 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  29.39 
 
 		 277 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  35.52 
 
 		 285 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2857  spermidine synthase  35.02 
 
 		 817 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00246642  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  34.82 
 
 		 286 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3392  spermidine synthase  34.71 
 
 		 290 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00712121  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  36.29 
 
 		 285 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  34.15 
 
 		 375 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  39.66 
 
 		 286 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  37.45 
 
 		 285 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  35.51 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>