281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4893 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  96.43 
 
 		 504 aa  966    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  69.38 
 
 		 503 aa  745    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  98.41 
 
 		 504 aa  1009    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  100 
 
 		 504 aa  1021    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  67.4 
 
 		 503 aa  734    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  100 
 
 		 504 aa  1021    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  97.02 
 
 		 504 aa  971    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  100 
 
 		 504 aa  1021    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  62.23 
 
 		 525 aa  617  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  62.23 
 
 		 510 aa  618  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  61.43 
 
 		 525 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  61.43 
 
 		 525 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  58.28 
 
 		 499 aa  604  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  52.01 
 
 		 498 aa  532  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  52.98 
 
 		 528 aa  525  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  51.3 
 
 		 521 aa  511  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  50.7 
 
 		 508 aa  502  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  51.1 
 
 		 527 aa  495  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  50.3 
 
 		 510 aa  483  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  50.3 
 
 		 521 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  50 
 
 		 514 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  42.41 
 
 		 536 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  42.41 
 
 		 567 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  41.22 
 
 		 515 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  37.7 
 
 		 510 aa  350  4e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  41.06 
 
 		 533 aa  342  7e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  41.07 
 
 		 538 aa  340  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  42.59 
 
 		 528 aa  334  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  44.38 
 
 		 521 aa  318  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  38.83 
 
 		 529 aa  306  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  41.68 
 
 		 519 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  39.6 
 
 		 522 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  38.08 
 
 		 520 aa  286  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  38.28 
 
 		 520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  38.28 
 
 		 520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  38.88 
 
 		 520 aa  273  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  38.05 
 
 		 523 aa  268  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0906  spermidine synthase  31.49 
 
 		 570 aa  224  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.975863  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3836  spermidine synthase  34.11 
 
 		 595 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0396024  unclonable  0.000000000324026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0829  spermidine synthase  34.23 
 
 		 577 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3112  spermidine synthase  33.87 
 
 		 577 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0860  spermidine synthase  34.05 
 
 		 577 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0924  spermidine synthase  33.33 
 
 		 574 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3448  spermidine synthase  33.33 
 
 		 574 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193946  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3089  spermidine synthase  33.64 
 
 		 574 aa  210  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170369  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0890  spermidine synthase  33.33 
 
 		 574 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.164164  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0699  spermidine synthase  33.27 
 
 		 566 aa  207  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000065174  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3763  spermidine synthase  33.09 
 
 		 574 aa  206  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0914  spermidine synthase  33.15 
 
 		 574 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.013206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0724  spermidine synthase  34.35 
 
 		 576 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105401  hitchhiker  0.00000291342 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2666  spermidine synthase  31.58 
 
 		 571 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00544767  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4189  spermidine synthase  30.61 
 
 		 568 aa  199  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3480  spermidine synthase  32.37 
 
 		 575 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.212317  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0625  spermidine synthase  31.52 
 
 		 575 aa  195  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.415321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3264  spermidine synthase  33.27 
 
 		 586 aa  193  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.239403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5301  spermidine synthase  44.96 
 
 		 360 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000883431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4905  spermidine synthase  44.96 
 
 		 369 aa  190  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4890  spermidine synthase  44.96 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  44.73 
 
 		 363 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5627  spermidine synthase  44.73 
 
 		 360 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000165937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5060  spermidine synthase  44.54 
 
 		 360 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5445  spermidine synthase  44.54 
 
 		 360 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5377  spermidine synthase  44.54 
 
 		 375 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  31.48 
 
 		 303 aa  137  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2430  Spermine synthase  27.35 
 
 		 529 aa  131  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514854  hitchhiker  0.00202916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2857  spermidine synthase  37.5 
 
 		 817 aa  130  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00246642  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  33.8 
 
 		 305 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  30.92 
 
 		 304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  31.09 
 
 		 312 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  31.27 
 
 		 326 aa  127  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  32.77 
 
 		 314 aa  127  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  33.07 
 
 		 291 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  34.39 
 
 		 280 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  34.93 
 
 		 301 aa  121  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  34.39 
 
 		 280 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  32.17 
 
 		 291 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  33.94 
 
 		 280 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  32.73 
 
 		 289 aa  120  7e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  33.5 
 
 		 291 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  31.2 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  29.76 
 
 		 281 aa  118  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  29.88 
 
 		 308 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  31.22 
 
 		 279 aa  117  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  31.65 
 
 		 291 aa  117  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  30.53 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  28.63 
 
 		 285 aa  115  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  29.35 
 
 		 304 aa  115  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  33.04 
 
 		 307 aa  114  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  33.74 
 
 		 328 aa  113  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  32.13 
 
 		 279 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  33.48 
 
 		 288 aa  113  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  28.08 
 
 		 283 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  30.23 
 
 		 276 aa  111  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  28.2 
 
 		 283 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  28.97 
 
 		 289 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  29.58 
 
 		 289 aa  109  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  27.86 
 
 		 283 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  29.92 
 
 		 275 aa  108  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  31.75 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  30.73 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>