264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1994 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  100 
 
 		 757 aa  1500    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0905  Spermine synthase  25.54 
 
 		 805 aa  201  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0140843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2430  spermine synthase  25.66 
 
 		 704 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  28.34 
 
 		 510 aa  98.6  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  30.93 
 
 		 304 aa  91.7  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  27.44 
 
 		 536 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  26.04 
 
 		 498 aa  89  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  28.88 
 
 		 522 aa  88.6  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  20.89 
 
 		 508 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  27.08 
 
 		 1078 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  27.56 
 
 		 1078 aa  85.5  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  29.64 
 
 		 520 aa  85.1  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1079 aa  85.1  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  28.15 
 
 		 529 aa  84.3  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  33.33 
 
 		 991 aa  84.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  27.15 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  27.15 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  30.15 
 
 		 533 aa  83.2  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  27.15 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  26.7 
 
 		 504 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  28.23 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  31.82 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  27.8 
 
 		 520 aa  81.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  27.8 
 
 		 520 aa  81.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  36.8 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  28.9 
 
 		 538 aa  80.9  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  27.96 
 
 		 503 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  30.32 
 
 		 276 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  25.86 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  26.37 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  30.18 
 
 		 292 aa  77  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  27.42 
 
 		 515 aa  77  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  27.33 
 
 		 283 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  26.78 
 
 		 519 aa  76.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  25.7 
 
 		 283 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  25.79 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  32.5 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  25.79 
 
 		 504 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  31.25 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  24.12 
 
 		 782 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1816  spermidine synthase  31.82 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.150426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  28.66 
 
 		 312 aa  73.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  28.5 
 
 		 983 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  29.14 
 
 		 293 aa  73.6  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  33.08 
 
 		 288 aa  73.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  29.14 
 
 		 296 aa  73.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  26.38 
 
 		 528 aa  72.8  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  25.36 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  26.11 
 
 		 521 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  25.26 
 
 		 283 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  29.22 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  25.7 
 
 		 523 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  26.82 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  31.07 
 
 		 277 aa  72  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  33.96 
 
 		 320 aa  72  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  25.9 
 
 		 837 aa  72  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  27.01 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  29.19 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  33.96 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  29.08 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  33.6 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3480  spermidine synthase  23.03 
 
 		 575 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.212317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  32 
 
 		 286 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  27.17 
 
 		 289 aa  70.5  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  31.45 
 
 		 286 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  27.73 
 
 		 280 aa  70.1  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  26.3 
 
 		 982 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  26.63 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  30 
 
 		 903 aa  70.1  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  26.79 
 
 		 803 aa  68.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1613  spermine synthase  28.72 
 
 		 753 aa  68.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0627097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  28.65 
 
 		 525 aa  67.8  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  28.85 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  28.65 
 
 		 525 aa  67.8  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0906  spermidine synthase  23.06 
 
 		 570 aa  67.8  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.975863  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  25.58 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  25 
 
 		 301 aa  67  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  28.07 
 
 		 510 aa  67  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  25.74 
 
 		 283 aa  67  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  25.74 
 
 		 283 aa  67  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  27.76 
 
 		 520 aa  67.4  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  32.06 
 
 		 285 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  32.06 
 
 		 285 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  30.82 
 
 		 295 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  31.18 
 
 		 296 aa  66.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  36.26 
 
 		 1040 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  28.07 
 
 		 525 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  26.94 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  27.33 
 
 		 567 aa  65.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40259  predicted protein  26.29 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0644688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  27.27 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04883  putative integral membrane protein  28.42 
 
 		 494 aa  65.1  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  27.56 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  30.65 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  28.71 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3836  spermidine synthase  23.31 
 
 		 595 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0396024  unclonable  0.000000000324026 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  25.12 
 
 		 521 aa  64.3  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  30.33 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  23.89 
 
 		 527 aa  63.9  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  25.79 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>