More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2756 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  98.24 
 
 		 1078 aa  2017    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  100 
 
 		 1078 aa  2050    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  92.49 
 
 		 1079 aa  1770    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  36.91 
 
 		 983 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  35.97 
 
 		 991 aa  386  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  36.76 
 
 		 982 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  33.53 
 
 		 1017 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  33.8 
 
 		 836 aa  316  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  35.15 
 
 		 876 aa  304  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  34.19 
 
 		 844 aa  299  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  31.89 
 
 		 749 aa  291  5.0000000000000004e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  35.27 
 
 		 842 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  35.53 
 
 		 830 aa  265  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  31.5 
 
 		 782 aa  247  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  29.63 
 
 		 819 aa  223  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  29.27 
 
 		 803 aa  223  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  34.1 
 
 		 835 aa  220  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  29.08 
 
 		 837 aa  218  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  33.14 
 
 		 903 aa  202  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  29.34 
 
 		 758 aa  191  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  37.99 
 
 		 1040 aa  184  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  29.7 
 
 		 875 aa  180  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  30.24 
 
 		 759 aa  138  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  29.76 
 
 		 765 aa  138  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2651  putative spermidine synthase  29.86 
 
 		 765 aa  135  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1613  spermine synthase  31.6 
 
 		 753 aa  132  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0627097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  27.2 
 
 		 527 aa  108  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  34.18 
 
 		 522 aa  92.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  24.49 
 
 		 498 aa  91.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  24.18 
 
 		 533 aa  90.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  26.3 
 
 		 521 aa  88.2  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  20.91 
 
 		 508 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  23.22 
 
 		 516 aa  87.8  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  31.16 
 
 		 523 aa  87  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04883  putative integral membrane protein  27.23 
 
 		 494 aa  86.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  30.47 
 
 		 520 aa  86.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  26.79 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  25.68 
 
 		 521 aa  84  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  36.77 
 
 		 287 aa  83.2  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  37.75 
 
 		 286 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  24.62 
 
 		 536 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  37.75 
 
 		 286 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  30.9 
 
 		 502 aa  83.2  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  26.13 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  26.13 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  26.13 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  27.19 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  26.82 
 
 		 528 aa  81.6  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  36 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.36 
 
 		 810 aa  81.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  26.13 
 
 		 504 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  28.08 
 
 		 275 aa  80.1  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 878 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  30.33 
 
 		 291 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  29.39 
 
 		 290 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  36.42 
 
 		 286 aa  79.3  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  29.36 
 
 		 757 aa  79.7  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  30.46 
 
 		 607 aa  79.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  22.2 
 
 		 558 aa  79.3  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  25.83 
 
 		 504 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  33.73 
 
 		 550 aa  78.6  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  34.67 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  34.67 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  34.67 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  25.51 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  29.58 
 
 		 538 aa  77.8  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  25.17 
 
 		 525 aa  77.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  31.19 
 
 		 520 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  31.3 
 
 		 304 aa  77.8  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  26.14 
 
 		 541 aa  77.8  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  29.49 
 
 		 290 aa  77.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  30.29 
 
 		 289 aa  77  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  33.33 
 
 		 286 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  37.5 
 
 		 519 aa  76.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  24.83 
 
 		 514 aa  76.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  26.73 
 
 		 533 aa  76.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 217 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  27.94 
 
 		 302 aa  76.6  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  31.43 
 
 		 288 aa  76.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  31.43 
 
 		 288 aa  76.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  31.43 
 
 		 288 aa  76.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  32.67 
 
 		 286 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  31.43 
 
 		 288 aa  76.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  31.43 
 
 		 288 aa  76.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  31.43 
 
 		 288 aa  76.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  31.43 
 
 		 288 aa  76.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  35.33 
 
 		 287 aa  76.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  31.43 
 
 		 288 aa  76.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  23.7 
 
 		 529 aa  76.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  29.89 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2430  spermine synthase  27.36 
 
 		 704 aa  75.1  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  31.97 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  27.09 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  26.58 
 
 		 528 aa  74.3  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.4 
 
 		 632 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  26.69 
 
 		 551 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  30.86 
 
 		 288 aa  73.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  25.18 
 
 		 510 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  26 
 
 		 567 aa  73.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  27.07 
 
 		 277 aa  73.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>