13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04884 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04884  spermine/spermidine synthase family protein  100 
 
 		 92 aa  177  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.934898  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  44 
 
 		 765 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  40.96 
 
 		 1017 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2651  putative spermidine synthase  40.91 
 
 		 765 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  42.22 
 
 		 819 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  38.04 
 
 		 991 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1613  spermine synthase  42.37 
 
 		 753 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0627097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  34.25 
 
 		 1079 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  33.33 
 
 		 1078 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  34.25 
 
 		 1078 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  36.05 
 
 		 758 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  35.56 
 
 		 803 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  47.27 
 
 		 842 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>