131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5606 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  100 
 
 		 758 aa  1516    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  39.34 
 
 		 803 aa  491  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  38.46 
 
 		 819 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  29.32 
 
 		 991 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  30.07 
 
 		 983 aa  197  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  28.92 
 
 		 1017 aa  183  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  29.34 
 
 		 1078 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  28.34 
 
 		 982 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  29.34 
 
 		 1078 aa  180  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  29.16 
 
 		 1079 aa  178  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  26.61 
 
 		 749 aa  167  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  26.33 
 
 		 876 aa  165  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  26.88 
 
 		 844 aa  156  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  25.71 
 
 		 842 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  26.17 
 
 		 837 aa  144  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  26.79 
 
 		 830 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  25.61 
 
 		 835 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  26.5 
 
 		 782 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  27 
 
 		 903 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  24.79 
 
 		 875 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  28.18 
 
 		 759 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  25.78 
 
 		 1040 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  33.81 
 
 		 765 aa  92  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  24.1 
 
 		 836 aa  84.3  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  29.63 
 
 		 304 aa  80.1  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2651  putative spermidine synthase  35.74 
 
 		 765 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  30.43 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  24.02 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  26.63 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  28.12 
 
 		 302 aa  63.9  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  28.93 
 
 		 285 aa  63.5  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  26.88 
 
 		 757 aa  60.8  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  26.14 
 
 		 313 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  30.95 
 
 		 220 aa  59.7  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1613  spermine synthase  32.72 
 
 		 753 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0627097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  27.34 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  23.98 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  31.91 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  30 
 
 		 289 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  29.22 
 
 		 349 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  24.53 
 
 		 291 aa  56.6  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  23.03 
 
 		 296 aa  56.2  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  23.03 
 
 		 293 aa  56.2  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  22.31 
 
 		 558 aa  55.8  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  28.08 
 
 		 517 aa  55.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  23.42 
 
 		 290 aa  54.7  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  29.58 
 
 		 521 aa  54.7  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  33.08 
 
 		 286 aa  54.3  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  26.62 
 
 		 310 aa  54.3  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  29.58 
 
 		 510 aa  54.3  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  27.92 
 
 		 375 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  26.49 
 
 		 529 aa  53.5  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  25.17 
 
 		 502 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  28.57 
 
 		 524 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  27.27 
 
 		 510 aa  52.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  28.03 
 
 		 283 aa  52  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  28.03 
 
 		 283 aa  52  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  27.94 
 
 		 514 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  27.94 
 
 		 514 aa  52  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  26.72 
 
 		 279 aa  52  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0905  Spermine synthase  24.22 
 
 		 805 aa  52  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0140843 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  25.62 
 
 		 748 aa  52  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  25.9 
 
 		 277 aa  51.6  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  24.29 
 
 		 275 aa  51.6  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  28.36 
 
 		 514 aa  51.2  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  29.14 
 
 		 527 aa  51.2  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  24.35 
 
 		 551 aa  50.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1314  spermidine synthase  27.33 
 
 		 278 aa  50.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  25.76 
 
 		 279 aa  50.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  27.01 
 
 		 280 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  29.59 
 
 		 541 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  27.01 
 
 		 280 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  26.45 
 
 		 283 aa  50.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  27.72 
 
 		 475 aa  50.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  25.55 
 
 		 286 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  24.7 
 
 		 490 aa  49.7  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  27.65 
 
 		 607 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  26.34 
 
 		 514 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  27.45 
 
 		 514 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  27.05 
 
 		 284 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  24.34 
 
 		 308 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  23.7 
 
 		 299 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  24.34 
 
 		 308 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  26.4 
 
 		 514 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  33.05 
 
 		 286 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  25.95 
 
 		 280 aa  49.3  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04883  putative integral membrane protein  24.22 
 
 		 494 aa  48.9  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3123  spermidine synthase  26.36 
 
 		 283 aa  48.9  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  27.13 
 
 		 286 aa  48.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  24.22 
 
 		 508 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03650  spermidine synthase  25.76 
 
 		 285 aa  48.1  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  28.1 
 
 		 284 aa  47.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  24.82 
 
 		 291 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  27.21 
 
 		 305 aa  47.8  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  24.69 
 
 		 292 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  23.39 
 
 		 287 aa  47  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  24.82 
 
 		 286 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  25.55 
 
 		 286 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2411  spermidine synthase  27.07 
 
 		 278 aa  47  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40259  predicted protein  24.36 
 
 		 316 aa  47.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0644688  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>