49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4321 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  431  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  36.76 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  33.67 
 
 		 490 aa  118  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  37.36 
 
 		 517 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  35.03 
 
 		 516 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7525  hypothetical protein  36.2 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  37.11 
 
 		 524 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  36.42 
 
 		 544 aa  92.8  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  35.71 
 
 		 502 aa  92.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  33.88 
 
 		 551 aa  92  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  32.39 
 
 		 533 aa  90.1  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  33.94 
 
 		 607 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  35.8 
 
 		 541 aa  85.5  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  31.49 
 
 		 558 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  31.15 
 
 		 510 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3029  hypothetical protein  32.1 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  31.29 
 
 		 551 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  29.79 
 
 		 548 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  29.27 
 
 		 551 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  28.11 
 
 		 974 aa  67.4  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  28.26 
 
 		 517 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  28.65 
 
 		 517 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  25.54 
 
 		 514 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  25.54 
 
 		 514 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  29.13 
 
 		 803 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  23.78 
 
 		 514 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  23.78 
 
 		 514 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  28.49 
 
 		 819 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  24.46 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  24.18 
 
 		 983 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  26.06 
 
 		 1078 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  27.03 
 
 		 982 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1079 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  26.06 
 
 		 1078 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  29.44 
 
 		 500 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  27.95 
 
 		 876 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  25.84 
 
 		 991 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  22.5 
 
 		 830 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  23.03 
 
 		 836 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  23.7 
 
 		 492 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  30.86 
 
 		 765 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  26.7 
 
 		 749 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  23.5 
 
 		 1040 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  26.32 
 
 		 475 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  27.14 
 
 		 1017 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  27.08 
 
 		 844 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  26.97 
 
 		 516 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  26.19 
 
 		 681 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  27.22 
 
 		 471 aa  41.6  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>